Author(s): Cruz, Leonor
Date: 2007
Persistent ID: http://hdl.handle.net/10451/1524
Origin: Repositório da Universidade de Lisboa
Subject(s): Ralstonia solanacearum; Diagnóstico; Epidemiologia; Filotipos; Hospedeiros alternativos; Teses de doutoramento
Tese de doutoramento em Biologia (Microbiologia), apresentada à Universidade de Lisboa através da Faculdade de Ciências, 2008
Descreve-se o estado da arte dos conhecimentos mais relevantes e explicativos da doença do pus ou mal murcho e do seu agente causal Ralstonia solanacearum. Enumeram-se os sintomas da doença em culturas solanáceas e o seu historial em Portugal, bem como as repercussões da sua presença a nível sócio-económico. Procede-se ao enquadramento sistemático e taxonómico do seu agente causal, evidenciam-se os conhecimentos despoletados pela sequenciação do genoma da estirpe GMI1000, e os desenvolvimentos ocorridos relativamente à patobiologia deste organismo. Finalmente, apresenta-se uma visão holística dos meios de protecção disponíveis. Estuda-se a fidedignidade dos métodos de detecção e identificação de Ralstonia solanacearum, e os condicionalismos subjacentes à natureza das amostras de origem biótica e ambiental, numa perspectiva de optimização de recursos. Critica-se a necessidade de implementar estratégias para optimização da aplicabilidade de novos métodos à rotina de um laboratório de análise. Procede-se ao estudo epidemiológico dos resultados obtidos na identificação de Ralstonia solanacearum, a partir de amostras de diferentes matrizes, analisadas entre 1999 e 2006, retirando-se conclusões sobre os principais factores de risco, incidência e presença de condicionantes de natureza climática na dispersão deste organismo. Identificam-se ainda plantas espontâneas como hospedeiros alternativos, e analisa-se o seu potencial na manutenção da doença. Através de uma abordagem polifásica, procede-se à caracterização fenética de uma colecção de isolados de Ralstonia solanacearum, e retiram-se conclusões sobre diferentes introduções deste organismo em Portugal. O estudo filogenético de um grupo de isolados, representativo da diversidade da colecção inicial, permitiu ainda esclarecer o enquadramento epidemiológico das estirpes deste organismo presentes no país a nível mundial, e verificar a introdução de uma nova população de largo espectro de hospedeiros. Por fim, numa perspectiva da interacção patogéneo-hospedeiro, faz-se o estudo comparativo das potencialidades de Solanum nigrum e Solanum dulcamara na manutenção, infecção e colonização de Ralstonia solanacearum, em condições controladas.
The state of the art concerning relevant knowledge about bacterial wilt and its causative agent Ralstonia solanacearum - is reviewed. Typical symptoms of disease on solanaceous crops, history and its economic impact in Portugal are described. The systematic and taxonomic outline of its agent is addressed and remarks on the progresses accomplished by the complete genome sequencing of strain GMI1000, as well as new pathobiological aspects, are highlighted. Topics on a holistic view of the available crop protection media are also presented. Reliability of the diagnostic tools used in the detection and identification of Ralstonia solanacearum, and the restrictions created by samples nature, namely their biotic or environmental origin, are studied towards a resource optimization approach. The implementation of new strategies in order to optimize the use of novel detection methods in a diagnostic laboratory is discussed. An epidemiological study is made based on the results obtained from analysed samples of different matrixes, for the detection and identification of Ralstonia solanacearum, between 1999 and 2006. Relevant risk factors are identified as well as the presence of environmental factors involved in its dispersion. Alternative hosts are also identified and their potential as inoculum sources was analysed.Based on a polyphasic approach, a collection of Ralstonia solanacearum isolates isphenetically characterized and conclusions are drawn about different introductionsof this organism in Portugal. A phylogenetic study, using a panel of isolates representative of the whole diversity of Portuguese strains, allowed to unveil the epidemiological story of this organism on a global view, and to identify the presence of a new population with a broad host range.Finally, a comparative study of Solanum nigrum and Solanum dulcamara, concerning the host-pathogen interaction, enabled to disclose their role as alternative hosts in the infection and colonization process by Ralstonia solanacearum, under environmental controlled conditions.
