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Molecular characterization of norovirus, sapovirus and astrovirus in children with acute gastroenteritis from Bel?m, Par?, Brazil

Autor(es): Arag?o, Glic?lia Cruz ; Oliveira, Darleise de Souza ; Santos, Mirleide Cordeiro dos ; Mascarenhas, Joana D'Arc Pereira ; Oliveira, Consuelo Silva de ; Linhares, Alexandre da Costa ; Gabbay, Yvone Benchimol

Data: 2018

Origem: Oasisbr

Assunto(s): Gastroenterite / etiologia; Sapovirus; Norovirus; Mamastrovirus; Infec??es por Astroviridae; Dados de Sequ?ncia Molecular; Rea??o em Cadeia da Polimerase / m?todos; Infec??es por Astroviridae / diagn?stico


Descrição

Minist?rio da Sa?de. Secretaria de Vigil?ncia em Sa?de. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.

Minist?rio da Sa?de. Secretaria de Vigil?ncia em Sa?de. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.

Minist?rio da Sa?de. Secretaria de Vigil?ncia em Sa?de. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.

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Minist?rio da Sa?de. Secretaria de Vigil?ncia em Sa?de. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.

Minist?rio da Sa?de. Secretaria de Vigil?ncia em Sa?de. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.

Minist?rio da Sa?de. Secretaria de Vigil?ncia em Sa?de. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.

A import?ncia dos norov?rus (NoVs), sapov?rus (SaVs) e astrov?rus humanos (HAstVs) como causa de surtos de gastrenterites j? est? bem definida. Entretanto, poucos estudos t?m descrito casos espor?dicos de gastrenterite aguda causados por esses agentes. O objetivo deste estudo foi determinar o papel destes v?rus na etiologia das gastrenterites agudas em crian?as atendidas durante uma vigil?ncia intensiva realizada em hospitais e ambulat?rios de Bel?m, Brasil, de mar?o a setembro de 2003. Um total de 305 esp?cimes fecais de pacientes com gastrenterite grave foram coletados e testados por rea??o em cadeia da polimerase precedida de transcri??o reversa (RT-PCR), utilizando iniciadores espec?ficos Mon 269 e Mon 270 para os HAstVs; p289 e p290 para os caliciv?rus humanos (HuCVs); e Mon 431/433 e Mon 432/434 para os NoVs. Sequenciamento dos amplicons de HAstV, HuCVs e NoVs, obtidos por RT-PCR, foi realizado usando os mesmos iniciadores. Das 305 amostras testadas, 96 (31,5%) apresentaram resultados positivos, sendo que 51 diagnosticadas como HuCVs, 40 como HAstVs e cinco infec??es mistas. Das 56 (18,4%) amostras de HuCVs sequenciadas, 30 foram NoVs (9,8%) pertencentes aos genogrupos GI-4 e GII-4, e 15 (4,9%) SaVs dos grupos GI-1, GI-2 e GII-1. HAstVs foram detectados em 45 (14,7%) das amostras, incluindo os gen?tipos 1, 8 e 2. Esta pesquisa ressalta a import?ncia destas viroses como causa de gastrenterite aguda e demonstra a circula??o de diferentes gen?tipos durante o per?odo de estudo. Estes resultados refor?am a necessidade de se estabelecer uma vigil?ncia intensiva das gastrenterite causadas por estes v?rus, de forma a poder avaliar o impacto da doen?a e monitorar os gen?tipos circulantes.

The importance of norovirus (NoVs), sapovirus (SaVs) and human astrovirus (HAstVs) as causes of gastroenteritis outbreaks is already well-defined, but a few studies have described sporadic cases of acute gastroenteritis caused by these viral entities. The aim of this study was to determine the role of these viruses in the etiology of acute gastroenteritis in children enrolled to participate in hospital ? and emergency department ? based intensive surveillance carried out in Bel?m, Brazil, from March to September 2003. A total of 305 stool specimens from patients with severe gastroenteritis were collected and screened by reverse transcription followed by polymerase chain reaction (RT-PCR), using the specific primers Mon 269 and Mon 270 for HAstVs, p289 and p290 for human calicivirus (HuCVs), and Mon 431/433 and Mon 432/434 for NoVs. Sequencing of RT-PCR HAstV, HuCV and NoV amplicons was carried out using the same primers. Of the 305 samples tested, 96 (31.5%) were positive, with 51 diagnosed as HuCVs, 40 as HAstVs and five as mixed infections. Of the 56 (18.4%) HuCVs sequenced, 30 were NoVs (9.8%) of genogroups GI-4 and GII-4, and 15 (4.9%) were SaVs of types GI-1, GI-2 and GII-1. HAstVs, including genotypes 1, 8 and 2, were detected in 45 (14.7%) samples. This study has highlighted the importance of these viruses as causes of acute gastroenteritis and established the circulation of different genotypes during the study period. These results reinforce the need for establishing an intensive surveillance for gastroenteritis caused by these viruses to assess the burden of disease and to monitor the circulation of genotypes.

Tipo de Documento Artigo científico
Idioma Português
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