Caracteriza??o gen?mica e an?lise filogen?tica de cepas antig?nicamante relacionadas ao v?rus Oropouche (Bunyaviridae, Orthobunyavirus) isoladas nas Am?ricas

• Author(s): Rosa, Jorge Fernando Soares Travassos da
• Date: 2018
• Origin: Oasisbr
• Subject(s): Arbovirus; Bunyaviridae / classifica??o; Infec??es por Bunyaviridae; Genoma Viral / gen?tica; Epidemiologia Molecular; Rearranjo G?nico
• Document Type: Doctoral thesis
• Language: Portuguese

Description

Minist?rio da Sa?de. Secretaria de Vigil?ncia em Sa?de. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.

Resumo: O v?rus Oropouche (VORO) pertencente ? fam?lia Bunyaviridae, g?nero Orthobunyavirus ? o agente etiol?gico da febre do Oropouche e se apresenta como um dos mais importantes arbov?rus causadores de doen?as em humanos na Amaz?nia brasileira, com relev?ncia em sa?de p?blica. Dezenas de epidemias, entre 1961 a 2009, foram registradas nos diferentes centros urbanos da Amaz?nia brasileira. Tamb?m de import?ncia foram as epidemias ocorridas em pa?ses como Panam? e Peru. O objetivo deste estudo retrospectivo foi a de caracterizar o genoma completo e descrever a epidemiologia molecular de diferentes cepas do VORO isoladas nas Am?ricas. Para o desenvolvimento desse projeto, foram utilizadas 133 amostras, sendo 24 recebidas do Departamento de Patologia da Universidade do Texas, Galveston, Estados Unidos da Am?rica e 109 provenientes do Genbank, de amostras pertencentes ? Se??o de Arbovirologia e Febres Hemorr?gicas do Instituto Evandro Chagas. As 24 amostras foram cultivadas em c?lulas VERO e tratadas com nucleases para posterior extra??o do RNA viral, empregando kits comerciais. Os RNAs foram submetidos ao sequenciamento pelo Ion Torrent Personal Genome Machine (PGM). As sequ?ncias completas obtidas foram avaliadas quanto ?s caracter?sticas gen?ticas, ? similaridade com outras sequ?ncias do VORO dispon?veis no Genbank, filogenia e quanto ? possibilidade de rearranjo gen?tico. Como resultados principais, detectou-se a presen?a do gen?tipo I do VORO no Panam?, bem como se observou rearranjo viral entre as cepas do estudo e os VORO, v?rus Iquitos e v?rus Madre de Dios. Esses dados ser?o ?teis para uma melhor compreens?o da biologia molecular e da epidemiologia molecular desse importante v?rus e sua dissemina??o nas Am?ricas.