Identificação genética humana: estudos de novos marcadores genéticos do tipo STR e InDel

• Author(s): Matos, Sara Mulenas Sá de
• Date: 2013
• Persistent ID: http://hdl.handle.net/10400.26/5125
• Origin: Egas Moniz - Cooperativa de Ensino Superior, CRL
• Subject(s): Marcadores genéticos; Short Tandem Repeats; InDel
• Document Type: Master thesis
• Language: Portuguese
• Advisor(s): Amorim, António; Silva, Claúdia
• Contributor(s): Repositório Comum

Description

Dissertação para a obtenção do grau de Mestre em Biologia Molecular em Saúde

Os marcadores genéticos do tipo Short Tandem Repeats (STR), são os atualmente recomendados para a obtenção de perfis genéticos, sendo que, muito recentemente foi apresentado como obrigatório para uso forense, um novo conjunto destes marcadores. Não obstante, existem também outros tipos de marcadores genéticos passíveis de utilização para definir perfis genéticos, designadamente marcadores do tipo Inserção/Deleção, ou InDel. Os novos marcadores STR e a grande maioria dos marcadores InDel ainda não estão suficientemente estudados e implementados nos laboratórios forenses, pelo que é necessário validar a reação, calcular frequências alélicas, parâmetros estatísticos populacionais e forenses. Estudámos os novos marcadores STR e um conjunto de marcadores do tipo InDel numa amostra com cerca de 120 indivíduos do sul de Portugal, intervenientes em perícias médico-legais a decorrer no Instituto Nacional de Medicina Legal e Ciências Forenses. No que concerne aos marcadores STR incluídos no kit PowerPlex®ESI17 (promega), os ensaios de validação demonstraram a sua elevada sensibilidade, precisão e capacidade de detetar misturas de DNA. No entanto, relativamente aos limiares analíticos não está de acordo com o descrito anteriormente. Os parâmetros estatísticos populacionais e forenses estão de acordo com o esperado e o cálculo das distâncias genéticas demonstrou existir diferenças genéticas entre as populações em estudo. Relativamente aos marcadores do tipo InDel incluídos no kit Investigator DIPPlex® (Qiagen), os ensaios de validação demonstraram que o kit tem uma elevada sensibilidade, limiares analíticos relativamente baixos, boa capacidade de detetar misturas e boa precisão. As frequências alélicas estão em equilíbrio Hardy-Weinberg, no entanto os valores de heterozigotia não são os esperados. Os parâmetros estatísticos forenses estão de acordo com o esperado e o cálculo das 4 distâncias genéticas demonstrou que existem diferenças genéticas significativas relativamente a outras populações. Concluímos que ambos os kits poderão ser utilizados para a prática forense apesar de, aparentemente, não preencherem todos os requisitos habitualmente avançados para os marcadores genéticos a utilizar na rotina forense. Deverão ser realizados mais estudos com maior número de indivíduos e de diferentes populações.