Implementação de um método de validação do controlo de qualidade em amostras de DNA armazenadas no Biobanco-IMM

• Author(s): Silva, Vanessa Gonçalves
• Date: 2014
• Persistent ID: http://hdl.handle.net/10400.26/6313
• Origin: Egas Moniz - Cooperativa de Ensino Superior, CRL
• Subject(s): Amostras de DNA; Controlo de qualidade; ACVR2B
• Document Type: Master thesis
• Language: Portuguese
• Advisor(s): Caetano-Lopes, Joana
• Contributor(s): Repositório Comum

Description

Dissertação para obtenção do grau de Mestre em Biologia Molecular em Saúde

No Biobanco-IMM as amostras são colhidas e armazenadas por longos períodos de tempo sendo de extrema importância que estas sejam de elevada qualidade. Para cumprir este requisito, os procedimentos do biobanco efetuam-se de acordo com diretrizes internacionais para a avaliação da qualidade das amostras que armazena.

No Biobanco-IMM, as amostras de DNA são extraídas e avaliadas em relação à sua concentração, pureza (razão A260/A280) e integridade. Por vezes, uma pequena percentagem das amostras pode não cumprir estes parâmetros de qualidade e uma vez que estas amostras são muitas vezes irrecuperáveis, surge a necessidade de testar a funcionalidade do DNA. O PCR é uma técnica largamente utilizada, pelo que outros biobancos internacionais, com os quais o Biobanco-IMM mantém estreita relação, aplicam esta técnica para complementar o procedimento de controlo de qualidade. Assim, este trabalho teve por objetivo implementar um método que comprove a funcionalidade das amostras de DNA armazenadas no Biobanco-IMM. Foram selecionadas amostras de cinco coleções representativas do Biobanco-IMM e amostras que não cumpriam os parâmetros de qualidade atualmente implementados. Segundo os resultados, as amostras pertencentes às cinco coleções apresentam boa amplificação do gene ACVR2B por PCR. Foi também observado que mesmo as amostras que se situavam fora do controlo de qualidade (87,8%) apresentaram amplificação, o que sugere que, mesmo que algumas amostras não cumpram os parâmetros de controlo de qualidade já aplicado no biobanco, poderão ser utilizadas, desde que se revelem funcionais. Segundo estes resultados, sugere-se que a adaptação do procedimento de CQ das amostras de DNA passe por acrescentar a técnica de PCR quando as amostras traduzam uma razão A260/280 < 1,7 ou > 2,0 e/ou não apresentem uma banda íntegra em gel de agarose.