Author(s): Lopes, Ricardo Alexandre Pinto
Date: 2017
Persistent ID: http://hdl.handle.net/10400.5/14656
Origin: Repositório da UTL
Subject(s): additive bayesian networks; antimicrobial; consumption; reduction; biosecurity; vaccination; production; productivity; directed acyclic graph; Denmark; Danish; sow herds; Redes aditivas bayesianas; antimicrobianos; biosegurança; vacinação; gráfico acíclico direcionado; varas de porcas; Dinamarca
Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina Veterinária
There is an increasing understanding that antimicrobial consumption must kept low, while not compromising productivity, in modern animal farming. However, viable alternatives to antimicrobials are needed. Using data regarding antimicrobial prescription, production, biosecurity and vaccination, amongst others, this project included an analysis of the network of interdependencies between these variables, to deepen the understanding of the interactions between the factors which make up pig farming. The dataset included data from 160 Danish sow herds, with information regarding the sow and the weaner sector of the production. With this in mind, additive bayesian networks methodologies were applied - a multivariate technique suited to process datasets of considerable size and complexity, which returns as final output a directed acyclic graph, representing of the network of associations between the parameters, and differencing direct from indirect ones. As such, it was discovered no association regarding antimicrobial consumption-related variables, indicating other factores, such as biosecurity, as more impactful in sow farming. The Danish SPF system, and all the standards it implies, also appeared as relevant. Although these results must be interpreted having the context of Danish pig farming in mind, it nonetheless reveals it is possible a reduction of the dependence in antimicrobials.
RESUMO - A rede de associações entre consumo de antimicrobianos, biosegurança, vacinação e produção: Uma análise de efetivos de porcas na Dinamarca, usando Redes Aditivas Bayesianas - A necessidade de reduzir o consumo de antimicrobianos faz-se sentir cada vez mais, na agropecuária atual. Contudo, é necessário garantir a manutenção dos níveis produtivos aquando desta redução, pelo que se afigura importante a identificação de alternativas viáveis aos antimicrobianos. Utilizando dados relativos à prescrição de antimicrobianos, parâmetros produtivos, biosegurança e vacinação, entre outros, o presente projeto conduziu uma análise à rede de interdependências entre as variáveis, com o objetivo de aprofundar conhecimento sobre a dinâmica das interações entre os vários fatores que determinam a produção porcina. Para o efeito, foi usada a metodologia de redes aditivas bayesianas, uma técnica multivariada destinada a bases de dados de tamanho e complexidade consideráveis, cujo resultado final se materializa num gráfico acíclico direcionado – uma representação visual da rede de associações entre todos os parâmetros, discriminando as diretas das indiretas. Como tal, foi descoberta uma ausência de associações relacionadas com consumo de antimicrobianos, indicando um maior impacto de outros fatores, como a biosegurança, na produção de porcas. O sistema SPF dinamarquês, e todos os padrões que engloba, também se revelaram influentes. Apesar destes resultados deverem ser interpretados à luz daquilo que é o contexto dinamarquês, constata-se ser possível a redução da dependência em antimicrobianos.
