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Estimativas de parâmetros genéticos para características de desempenho de suíno...
Torres Filho, R.A.; Torres, R.A.; Lopes, P.S.; Pereira, C.S.; Euclydes, R.F.; Araújo, C.V.; Silva, M.A.; Breda, F.C.Foram utilizados dados de conversão alimentar, espessura de toucinho corrigida para 100kg, idade para atingir 100kg e ganho de peso médio diário, para estimar parâmetros genéticos e fenotípicos de características de desempenho de suínos da raça Large White. As características estudadas foram avaliadas por sexo, em razão do manejo diferenciado para machos e fêmeas. Variâncias e covariâncias genéticas e fenotípic...
Mapeamento de QTL nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X em suínos: caracterís...
Paixão, D.M.; Carneiro, P.L.S.; Paiva, S.R.; Sousa, K.R.S.; Verardo, L.L.; Braccini Neto, J.; Pinto, A.P.G.; Hidalgo, A.M.; Souza do Nascimento, C.A realização do presente estudo teve como objetivo mapear Quantitative Trait Loci (QTL) de carcaça e qualidade de carne em uma população F2 de suínos desenvolvida pelo cruzamento de dois reprodutores da raça brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain). O mapa de ligação para essa população foi construído após a genotipagem de 684 animais para 35 marcadores microssatélites. Os da...
Candidate gene expression and intramuscular fat content in pigs
Serão, N.V.L.; Veroneze, R.; Ribeiro, A.M.F.; Verardo, L.L.; Braccini Neto, J.; Gasparino, E.; Campos, C.F.; Lopes, P.S.; Guimarães, S.E.F.Seventy-two pigs of three genetic groups (Brazilian indigenous breed Piau, Commercial line and Crossbred) of both sexes were slaughtered at four live weights (30, 60, 90 and 120 kg). Intramuscular fat (IMF) content in Longissimus dorsi muscle of each animal was extracted and correlated with candidate gene mRNA expression (ATN1, EEF1A2, FABP3, LDLR, MGP, OBSCN, PDHB, TRDN and RYR1). Within slaughter weight of 12...
Detecção de locos de características quantitativas nos cromossomos 1, 2, 3, 12,...
Paixão, D.M.; Braccini Neto, J.; Paiva, S.R.; Carneiro, P.L.S.; Pinto, A.P.G.; Sousa, K.R.S.; Souza do Nascimento, C.; Verardo, L.L.; Hidalgo, A.M.Mapeou-se quantitative trait loci (QTL) associados a características de desempenho nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X de suínos pertencentes a uma população F2, formada a partir do cruzamento entre dois machos da raça naturalizada brasileira Piau e 18 fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain). O mapa genético de ligação da população foi construído após a genotipagem dos animais para 35 marcador...
Carcass and ham quality characteristics of heavy pigs from different genetic gr...
Peloso, J.V.; Lopes, P.S.; Gomide, L.A.M.; Guimarães, S.E.F.; Carneiro, P.L.S.Carcass and ham quality characteristics of pig populations divided by harvest weights — HW (130 and 160 kg) were evaluated to determine the effects of gender (barrows and gilts) and distinct genetic groups — purebred (DUDU) and crossbred Duroc (DULA, DUWI and DULL) as well as purebred Large White (WIWI) on the suitability for use in dry-cured ham production. At 130 kg, DUDU pigs yielded the highest fat thicknes...
A genome-wide association study reveals a novel candidate gene for sperm motili...
Diniz, D.B.; Lopes, M.S.; Broekhuijse, M.L.W.J.; Lopes, P.S.; Harlizius, B.; Guimarães, S.E.F.; Duijvesteijn, N.; Knol, E.F.; Silva, F.F.Sperm motility is one of the most widely used parameters in order to evaluate boar semen quality. However, this trait can only be measured after puberty. Thus, the use of genomic information appears as an appealing alternative to evaluate and improve selection for boar fertility traits earlier in life. With this study we aimed to identify SNPs with significant association with sperm motility in two different co...
Identification and validation of differentially expressed genes from pig skelet...
Verardo, L.L.; Nascimento, C.S.; Silva, F.F.; Gasparino, E.; Martins, M.F.; Toriyama, E.; Faria, V.R.; Botelho, M.E.; Costa, K.A.; Lopes, P.S.Pig is an important animal for meat production; this is generally associated with characteristics determined prenatally during myogenesis. Expressed sequence tags (EST) can provide direct information on the transcriptome and indirect information on the relation between the genome and phenotype, giving information about differentially expressed genes (DEG). In this work, the identification and annotation of DEG ...
Inclusão da epistasia em modelo de avaliação genética de bovinos de corte compo...
Bueno, R.S.; Torres, R.A.; Ferraz, J.B.S.; Lopes, P.S.; Eler, J.P.; Silva, M. Almeida e; Euclydes, R.F.; Mattos, E.C.Dados de bovinos compostos foram analisados para avaliar o efeito da epistasia nos modelos de avaliação genética. As características analisadas foram os pesos aos 205 (P205) e 390 dias (P390) e perímetro escrotal aos 390 dias (PE390). As análises foram realizadas pela metodologia de máxima verossimilhança considerando-se dois modelos: o modelo 1 incluiu como covariáveis os efeitos aditivos diretos e maternos, e...
Supervised independent component analysis as an alternative method for genomic ...
Azevedo, C.F.; Silva, F.F.; Resende, M.D.V. de; Lopes, M.S.; Duijvesteijn, N.; Guimarães, S.E.F.; Lopes, P.S.; Kelly, M.J.; Viana, J.M.S.; Knol, E.F.The objective of this work was to evaluate the efficiency of the supervised independent component regression (SICR) method for the estimation of genomic values and the SNP marker effects for boar taint and carcass traits in pigs. The methods were evaluated via the agreement between the predicted genetic values and the corrected phenotypes observed by cross-validation. These values were also compared with other ...
Accounting for genetic architecture in single- and multipopulation genomic pred...
Veroneze, R.; Lopes, P.S.; Lopes, M.S.; Hidalgo, A.M.; Guimaraes, S.E.F.; Harlizius, B.; Knol, E.F.; Arendonk, J.A.M. van; Silva, F.F.We studied the effect of including GWAS results on the accuracy of single‐ and multipopulation genomic predictions. Phenotypes (backfat thickness) and genotypes of animals from two sire lines (SL1, n = 1146 and SL3, n = 1264) were used in the analyses. First, GWAS were conducted for each line and for a combined data set (both lines together) to estimate the genetic variance explained by each SNP. These estimate...