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Preparação e screening virtual de uma biblioteca de compostos de baixo peso molecular oriundos de cogumelos contra proteínas da família BCL-2

Author(s): Borges, Bianca Ferreira

Date: 2020

Persistent ID: http://hdl.handle.net/10198/22824

Origin: Biblioteca Digital da UPB

Subject(s): Screening virtual; Docking molecular; Família Bcl-2; LMW


Description

Os cogumelos apresentam uma grande diversidade na sua composição química, quer de compostos de alto peso molecular, quer compostos de baixo peso molecular (LMW-“Low Molecular Weight”). Devido a sua composição química os cogumelos apresentam inúmeras bioactividades, incluindo: atividade antioxidante, antitumoral, antimicrobiana entre outras. A atividade antitumoral de cogumelos tem sido associada a presença de polissacarídeos nos cogumelos, no entanto ha uma crescente base de conhecimento que mostra que compostos LMW também tem um papel essencial na atividade antitumoral de diferentes espécies de cogumelos. Neste trabalho começou-se por realizar uma pesquisa bibliográfica, de forma a selecionar compostos LMW, presentes em diferentes espécies de cogumelos e associados de alguma forma a uma atividade antitumoral. No total selecionaram-se 115 compostos que formaram a nova biblioteca LMW 2.0, que foi cuidadosamente preparada para estudos in silico. Em uma segunda parte do trabalho foram realizados estudos de screening virtual da biblioteca LMW 2.0 utilizando o software de docking molecular AutoDock 4.0, de forma a tentar estimar quais os compostos da biblioteca que poderão ser os melhores inibidores de 3 proteínas da família Bcl-2: a Bcl-2 (linfoma de célula B 2), a Bcl-XL (linfoma de células B extra grandes) e a MCL-1 (leucemia mieloide-1). Estas proteínas foram escolhidas pois estão envolvidas nas vias de sinalização da apoptose promovendo a sua inibição, sendo atualmente conhecidos alvos terapêuticos em processo tumorais. Assim este trabalho teve como objetivo tentar identificar compostos LMW, presentes em cogumelos, que possam potenciar a apoptose tumoral, interagindo com a família Bcl-2 de proteínas anti-apoptóticas. No geral a proteína MCL-1 parece ser mais sensível aos compostos da biblioteca LMW 2.0, com valores de Ki (constante de inibição) estimados mais baixos, variando entre 17,1 nM e 64,7 nM para os dez melhores compostos. De seguida os melhores resultados foram obtidos para a Bcl-XL com valores entre os 51,5 e 185,6 nM e finalmente os resultados menos interessantes foram da Bcl-2 com valores de Ki entre 140,7 nM e 281 nM. Os compostos glicosilados apresentaram no geral uma melhor capacidade inibidora estimada. A visualização em detalhe das conformações de interação previstas mostra que a melhor capacidade inibidora dos compostos glicolisados fica provavelmente a dever-se à interação da glucose com alguns aminoácidos polares que formam a orla exterior do centro ativo das proteínas em estudo.

Document Type Master thesis
Language Portuguese
Contributor(s) Biblioteca Digital da UPB; Abreu, Rui M.V.; Ineu, Rafael Porto
CC Licence
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