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Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade UnB Gama, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Biomédica, 2018.

O crescimento bacteriano em amostras biológicas é analisado por meio da contagem de colônias bacterianas que são em sua maioria determinadas em Unidades Formadoras de Colônias por mililitro (UFC/mL). Todas as técnicas de contagem atualmente disponíveis acarretam ônus e dificuldades na padronização do método e não mostraram-se eficazes para contagem de colônias bacterianas com características de espalhamento. Diante das dificuldades para padronização deste método, o objetivo desta pesquisa é propor um método semi automatizado, indicador de infecção urinária considerando a área superficial ocupada pelas colônias em placas de Petri e não o volume de amostra inoculada. Foram analisadas amostras que apresentaram crescimento bacteriano, e adquiridas imagens das placas por meio da plataforma AUTOBAC. Para a quantificação bacteriana foi determinada a área ocupada pelas colônias na superfície da placa de Petri, por meio de processos de limiarização realizados em um algoritmo desenvolvido no software Matlab. Os resultados obtidos por este algoritmo, foram satisfatórios e expressos em UFC/cm2, e quando comparados ao método Gold Standard apresentaram correlação e concordância aceitáveis em métodos diagnósticos.

Bacterial growth in biological samples is analyzed by counting bacterial colonies that are mostly determined in Colony Forming Units per milliliter (CFU / mL). All counting techniques currently available entail burdens and difficulties in the standardization of the method and were not effective in counting bacterial colonies with spreading characteristics. In view of the difficulties to standardize this method, the objective of this research is to propose a semi automated method, indicative of urinary infection considering the surface area occupied by the colonies in Petri dishes and not the inoculated sample volume. Samples that showed bacterial growth were analyzed, and images of the plates were acquired through the AUTOBAC platform. For the bacterial quantification the area occupied by the colonies on the surface of the Petri dish was determined by means of thresholding processes performed in an algorithm developed in Matlab software. The results obtained by this algorithm were satisfactory and expressed in CFU / cm2, and when compared to the Gold Standard method, they showed acceptable correlation and concordance in diagnostic methods.