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Genetic diversity of the root lesion nematode pratylenchus penetrans

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Summary:	Os nemátodes das lesões radiculares (NLR), Pratylenchus spp., são um grupo de nemátodes parasitas de plantas altamente polífagos, que têm um grande impacto económico a nível mundial. Pratylenchus penetrans é uma espécie importante de NLR do ponto de vista económico, pois afeta uma vasta gama de plantas cultivadas. Em Portugal, esta espécie é encontrada frequentemente em batateira, mas apesar da deteção prévia nesta cultura, existe pouca informação sobre as características morfométricas e moleculares de isolados portugueses. O objetivo deste estudo foi avaliar a variação inter e intra-isolados de P. penetrans em Portugal, bem como as relações moleculares com P. penetrans identificados noutros países e em outros hospedeiros. Na primeira parte deste estudo, os caracteres morfométricos de cinco isolados portugueses de P. penetrans, multiplicados in vitro em culturas de discos de cenoura, foram comparados, tendo sido encontrada variabilidade morfométrica dentro e entre os isolados. No entanto, as diferenças de variabilidade são semelhantes às descritas anteriormente para outros P. penetrans de outras partes do mundo. Dos 15 caracteres morfométricos estudados, a posição da vulva (razão de V) nas fêmeas e o comprimento do estilete, tanto nas fêmeas como nos machos, apresentaram o menor coeficiente de variabilidade intra e inter-isolado. A sua estabilidade confirma que estes caracteres são importantes no diagnóstico desta espécie. Na segunda parte do trabalho, foi avaliada a diversidade genética dos cinco isolados nas regiões genómicas COI e ITS. Os isolados apresentaram maior diversidade genética na região ITS do que na região COI, com 15 e 6 haplótipos diferentes, das 15 sequências ITS e 14 sequências COI, respetivamente. Foi encontrada diversidade genética intra isolado em todos os isolados analisados, com exceção de um isolado na região COI. Os resultados também mostraram que a diferenciação dos isolados de Portugal não estava relacionada com a sua origem geográfica. Apesar da elevada diversidade intraespecífica encontrada, as análises filogenéticas revelaram que ambas as regiões, COI e ITS, permitem separar as espécies de P. penetrans de outras espécies próximas, como P. pinguicaudatus, P. fallax e P. thornei. No entanto, não foi possível agrupar P. penetrans pertencentes ao mesmo país ou provenientes de hospedeiros semelhantes. A informação obtida neste estudo contribui para aumentar o conhecimento sobre a variabilidade de P. penetrans associados à cultura de batateira em Portugal.
Main Authors:	Gil, Diogo Melo da Silva Loureiro
Subject:	COI ITS Morfometria Portugal Variabilidade COI ITS Morphometry Portugal Variability
Year:	2020
Country:	Portugal
Document type:	master thesis
Access type:	embargoed access
Associated institution:	Universidade de Coimbra
Language:	English
Origin:	Estudo Geral - Universidade de Coimbra