Publicação
Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para aplicação em Química Medicinal: MOLA e ChemT.
| Resumo: | O desenvolvimento de novas ferramentas computacionais é uma parte integral da área da bioinformática. A disponibilização destas ferramentas em modalidade de acesso livre permitir o acesso a um maior número de utilizadores e facilita significativamente o seu desenvolvimento pela facilidade de troca de ideias entre utilizadores. Neste trabalho, serão apresentados dois softwares desenvolvidos pelo nosso grupo de investigação: 1) MOLA1 que automatiza o screening virtual de bibliotecas de compostos com baixa massa molar, utilizando as ferramentas de docking AutoDock4 e AutoDock Vina; 2) ChemT2 que permite a geração de bibliotecas de compostos análogos de baixa massa molar, tendo como base uma estrutura química de interesse. Será ainda apresentado um exemplo de screening virtual utilizando a VEGFR2 (Vascular Endothelial Growth Factor Receptor 2) como proteína alvo e uma biblioteca de compostos químicos derivados de tieno[3,2-b]piridinas. Neste exemplo, o MOLA foi utilizado para automatizar o processo de screnning virtual e o ChemT para gerar a biblioteca de derivados de tieno[3,2-b]piridinas. |
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| Autores principais: | Abreu, Rui M.V. |
| Outros Autores: | Froufe, Hugo J.C.; Queiroz, Maria João R.P.; Ferreira, Isabel C.F.R. |
| Ano: | 2011 |
| País: | Portugal |
| Tipo de documento: | documento de conferência |
| Tipo de acesso: | acesso aberto |
| Instituição associada: | Instituto Politécnico de Bragança |
| Idioma: | português |
| Origem: | Biblioteca Digital do IPB |
| Resumo: | O desenvolvimento de novas ferramentas computacionais é uma parte integral da área da bioinformática. A disponibilização destas ferramentas em modalidade de acesso livre permitir o acesso a um maior número de utilizadores e facilita significativamente o seu desenvolvimento pela facilidade de troca de ideias entre utilizadores. Neste trabalho, serão apresentados dois softwares desenvolvidos pelo nosso grupo de investigação: 1) MOLA1 que automatiza o screening virtual de bibliotecas de compostos com baixa massa molar, utilizando as ferramentas de docking AutoDock4 e AutoDock Vina; 2) ChemT2 que permite a geração de bibliotecas de compostos análogos de baixa massa molar, tendo como base uma estrutura química de interesse. Será ainda apresentado um exemplo de screening virtual utilizando a VEGFR2 (Vascular Endothelial Growth Factor Receptor 2) como proteína alvo e uma biblioteca de compostos químicos derivados de tieno[3,2-b]piridinas. Neste exemplo, o MOLA foi utilizado para automatizar o processo de screnning virtual e o ChemT para gerar a biblioteca de derivados de tieno[3,2-b]piridinas. |
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