Publicação

Broad host range plasmids in estuarine environments

Detalhes bibliográficos
Resumo:	A transferência horizontal de genes permite a adaptação microbiana a nichos especiais, dos quais dois bons exemplos são a camada superficial do mar e a coluna de água. Os plasmídeos com gama alargada de hospedeiros (BHR), responsáveis pelo fluxo de material genético entre cromossomas bacterianos (inclusivamente entre microorganismos muito afastados filogeneticamente) têm um papel essencial na evolução das comunidades microbianas. Entre eles, os plasmídeos pertencendo ao grupo de incompatibilidade IncP-1 têm um interesse especial por causa da sua extraordinária flexibilidade na iniciação da replicação e da estabilidade na sua manutenção numa ampla gama de hospedeiros. Estes elementos genéticos móveis, além de constituírem ferramentas úteis na engenharia genética, representam uma grande fonte de genes que codificam para características tão significativas como a resistência a antibióticos e a degradação de xenobióticos. No entanto, a diversidade nesta família de plasmídeos BHR tem sido subestimada até agora: actualmente sabe-se da existência de cinco subgrupos divergentes, mas embora alguns plamídeos modelo tenham sido estudados ao detalhe, ainda há muito para investigar. Em trabalhos anteriores na Ria de Aveiro (costa NW de Portugal), foi feita a captura exógena de plasmídeos bem como o isolamento de bactérias potencialmente hospedeiras de plasmídeos endógenos. Neste trabalho, sequências de nucleótidos específicas foram amplificadas mediante reacções em cadeia da polimerase para determinar a presença de plasmídeos BHR. Os sete plasmídeos IncP-1 detectados, foram em primeiro lugarfilogeneticamente estudados. O alinhamento das sequências de nucleótidos de 281 pb que foram amplificadas e que correspondem a um fragmento do gene trfA (que codifica para uma proteína do início da replicaçao) sugeriu o estabelecimento de dois novos clusters situados filogeneticamente em dois subgrupos diferentes de IncP-1: IncP-1β e o recentemente descrito IncP-1ε. Estes constituem os primeiros replicões IncP-1 provenientes de ambientes estuarinos a serem detectados e isolados. De seguida, uma comparação e caracterização preliminar genética e fenotípica foi realizada com os plasmídeos purificados, considerando a descrição já conhecida dos dois plasmídeos arquétipos evolutivamente mais próximos, pB10 e pKJK5. Assim, as análises de fragmentos de restrição, determinação da inibição do crescimento do hospedeiro na presença de mercúrio e ensaios de resistência a diferentes antibióticos ajudaram a compreender o elevado interesse que recai nestes plasmídeos revelando a diversidade fenotípica e genotípica. Uma completa descrição de qualquer destes novos plasmídeos pode ter una enorme importância ecológica, evolutiva e biotecnológica, incrementada pela sua procedência dum ambiente não clínico. Portanto este trabalho justifica um estudo em maior profundidade destes replicões promíscuos.
Autores principais:	Pinto, Beatriz Lázaro
Assunto:	Biotecnologia Plasmídeos Filogenia Transformação genética Comunidades microbiológicas Ambiente aquático - Águas superficiais
Ano:	2010
País:	Portugal
Tipo de documento:	dissertação de mestrado
Tipo de acesso:	acesso aberto
Instituição associada:	Universidade de Aveiro
Idioma:	inglês
Origem:	RIA - Repositório Institucional da Universidade de Aveiro