Publicação

Origem e filogeografia do VIH-1 no arquipélago de São Tomé e Príncipe

Detalhes bibliográficos
Resumo:	O VIH é um retrovírus que já causou a morte de cerca de 940 mil pessoas até 2017, e infetou mais de 36,9 milhões no mundo, sendo o continente africano a região do globo mais afetada pela epidemia. Este vírus altamente replicativo, recombinativo e com uma notável capacidade de mutação e adaptação às novas condições do ambiente humano, possui uma extraordinária diversidade genética global. O VIH-1 é o tipo mais predominante e disperso a nível global, e o principal agente da SIDA. Este vírus é classificado em grupos, subtipos, sub-subtipos, formas recombinantes circulantes (CFRs) e formas únicas circulantes (URFs). O grupo M do VIH-1 é o mais prevalente globalmente, e por isso estudar e conhecer a epidemiologia molecular deste grupo reveste-se de grande importância para a saúde mundial, para a melhoria da terapêutica ARV, para o alcance dos objetivos 90-90-90 definidos nos ODS (Objetivos do desenvolvimento sustentável) e para o desenvolvimento de vacinas. S.Tomé e Príncipe, é um pequeno arquipélago localizado na costa ocidental africana, caracterizado por prevalência baixa (0,5%) do VIH-1, mas com poucos estudos realizados na área da epidemiologia molecular das estirpes VIH-1 circulantes no país. Este trabalho de investigação tratou-se de um estudo observacional baseado na análise de sequências pol do VIH-1 colhidas em seropositivos, no período de 2004 a 2008 em S.Tomé e Príncipe. Com estas amostras foi possível determinar a diversidade genética das estirpes do VIH-1 que circulam no país, identificar as mutações de resistência aos antirretrovirais existentes e reconstruir a origem temporal e geográfica da epidemia a partir da estirpe mais prevalente identificada (CFR02_AG), através da reconstrução filogenética de uma árvore MCC (Maximum Credibility Clade) dessas sequências usando a estrutura filogeográfica bayesiana disponibilizadas no pacote do BEAST.
Autores principais:	BONFIM, Elisângela Jessica Vera Vruz Bonfim
Assunto:	Saúde pública Saúde pública e desenvolvimento Sida VIH - 1 São Tomé e Príncipe
Ano:	2020
País:	Portugal
Tipo de documento:	dissertação de mestrado
Tipo de acesso:	acesso aberto
Instituição associada:	Universidade Nova de Lisboa
Idioma:	português
Origem:	Repositório Institucional da UNL

Descrição
Resumo:	O VIH é um retrovírus que já causou a morte de cerca de 940 mil pessoas até 2017, e infetou mais de 36,9 milhões no mundo, sendo o continente africano a região do globo mais afetada pela epidemia. Este vírus altamente replicativo, recombinativo e com uma notável capacidade de mutação e adaptação às novas condições do ambiente humano, possui uma extraordinária diversidade genética global. O VIH-1 é o tipo mais predominante e disperso a nível global, e o principal agente da SIDA. Este vírus é classificado em grupos, subtipos, sub-subtipos, formas recombinantes circulantes (CFRs) e formas únicas circulantes (URFs). O grupo M do VIH-1 é o mais prevalente globalmente, e por isso estudar e conhecer a epidemiologia molecular deste grupo reveste-se de grande importância para a saúde mundial, para a melhoria da terapêutica ARV, para o alcance dos objetivos 90-90-90 definidos nos ODS (Objetivos do desenvolvimento sustentável) e para o desenvolvimento de vacinas. S.Tomé e Príncipe, é um pequeno arquipélago localizado na costa ocidental africana, caracterizado por prevalência baixa (0,5%) do VIH-1, mas com poucos estudos realizados na área da epidemiologia molecular das estirpes VIH-1 circulantes no país. Este trabalho de investigação tratou-se de um estudo observacional baseado na análise de sequências pol do VIH-1 colhidas em seropositivos, no período de 2004 a 2008 em S.Tomé e Príncipe. Com estas amostras foi possível determinar a diversidade genética das estirpes do VIH-1 que circulam no país, identificar as mutações de resistência aos antirretrovirais existentes e reconstruir a origem temporal e geográfica da epidemia a partir da estirpe mais prevalente identificada (CFR02_AG), através da reconstrução filogenética de uma árvore MCC (Maximum Credibility Clade) dessas sequências usando a estrutura filogeográfica bayesiana disponibilizadas no pacote do BEAST.