Publicação

Macrophages in M1/M2 states and exposed to amyloid-beta: a RNA-seq analysis in human cells

Ver documento

Detalhes bibliográficos
Resumo:A Doença de Alzheimer (DA) é uma doença associada à idade e é uma das doenças neurodegenerativas com maior prevalência mundial. Esta doença causa a destruição progressiva de funções cognitivas e memória, levando à eventual morte do indivíduo. Um dos principais achados patológicos, para esta doença, são as placas extracelulares constituídas por beta amilóide (Aβ) que são encontradas frequentemente no cérbero de pacientes com DA. Enquanto que os mecanismos envolvidos na progressão desta doença permanecem desconhecidos, algumas hipóteses foram propostas envolvendo estas placas amilóides. Uma dessas hipótese é conhecida como a hipótese cascata de amiloide, e esta propõe que, através de uma cascata de eventos, a acumulação das placas de Aβ eventualmente resulta em disfunção neuronal e eventual morte celular. Microglia, os macrófagos residentes no cérbero, foram encontrados perto destas placas e já foi provado que eles têm capacidade de fagocitar estas placas. Neste trabalho foi feita uma análise de RNA-seq em dados humanos, com o objectivo de comparar os perfis genéticos e de miRNA de um grupo de controlo, de macrófagos polarizados para os fenótipos M1 e M2a e de macrófagos estimulados com Aβ. Adicionalmente, também se pretendia descobrir novas vias ou genes expressos em macrófagos presentes num ambiente com Aβ. Para tal, uma análise de expressão diferencial foi feita, tanto para os dados relativos ao mRNA como para os dados relativos ao miRNA. Uma análise do enriquecimento funcional foi feita para ajudar na compreensão dos genes diferencialmente expressos no mRNA. Por fim, uma série de testes de correlação foram feitos de modo a perceber o quão influente é a expressão de miRNA sobre o seu mRNA alvo. Através da utilização de marcadores de expressão de mRNA e miRNA, foi possível verificar a polarização dos macrófagos para M1 e M2a. Além disso, foram descobertos alguns miRNA com alta expressão nos estados de polarização, que poderiam ajudar no estudo destes estados de polarização. Relativamente ao teste de correlação, os resultados estavam enviesados para correlações positivas devido a um miRNA em particular. Uma hipótese foi criada para tentar explicar esse resultado, mas nenhuma conclusão sólida foi alcançada neste projecto.
Autores principais:Lopes, Inês de Almeida
Assunto:Envelhecimento Doença de Alzheimer Beta amiloide Polarização de macrófagos RNA-seq Teses de mestrado - 2017
Ano:2017
País:Portugal
Tipo de documento:dissertação de mestrado
Tipo de acesso:acesso aberto
Instituição associada:Universidade de Lisboa
Idioma:inglês
Origem:Repositório da Universidade de Lisboa

Registos relacionados

Registos relacionados