Publicação
Análise estatística de dados de metabolómica: identificação dos compostos envolvidos na resposta das plantas à simbiose com fungos ectomicorrízicos
| Resumo: | A associação simbiótica entre as raízes e fungos micorrízicos do solo é extremamente importante para a nutrição e desenvolvimento das plantas. Apesar de haver já algum conhecimento sobre os genes (genoma/transcritoma) e proteínas (proteoma) envolvidos no processo de micorrização, sabe-se muito pouco sobre as alterações dos metabolitos da planta hospedeira quando esta se encontra em simbioses com o fungo micorrízico. Assim, a identificação do conjunto de metabolitos ou compostos biológicos (metaboloma) envolvidos na micorrização reveste-se de especial interesse para completar a informação fornecida pelo genoma/transcritoma e proteoma. Estes são os últimos produtos da expressão dos genes e, por isso, são extremamente informativos acerca das alterações moleculares que estão a acontecer nos organismos vivos. Sabe-se que os organismos vivos sujeitos a stresses ambientais (e.g. seca, salinidade do solo) ou durante interações com microrganismos simbióticos ou patogénicos, podem produzir metabolitos específicos ou sofrer alterações na quantidade de metabolitos já produzidos. A identificação destas alterações permite saber, a nível molecular, o que está a acontecer quando uma planta estabelece, por exemplo, uma relação simbiótica com um fungo da rizosfera. Neste estudo pretendeu-se contribuir para a identificação das alterações no metaboloma do sobreiro quando este se encontra em simbiose com um fungo micorrízico do solo. O metaboloma da raíz micorrizada do sobreiro foi extraído usando quatro frações compostas por diferentes solventes: água, metanol, acetonitrilo e clorofórmio (orgânica). Foram extraídas seis réplicas de plantas de sobreiros – sendo três micorrizadas e três utilizadas como grupo de controlo não micorrizado, para efeitos de comparação. Através da aplicação de métodos estatísticos tais como Rank Products, Modelos Lineares e Análise Discriminante por Mínimos Quadrados Parciais (PLS-DA) , foi possível a identificação dos metabolitos diferencialmente acumulados que possibilitarão a descoberta de novas informações sobre a identidade dos metabolitos envolvidos na simbiose entre o sobreiro e o fungo micorrízico, promovendo novos conhecimentos sobre as vias metabólicas implicadas na micorrização. |
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| Autores principais: | Bento, Bruno de Campos |
| Assunto: | Ectomicorrizas Quercus suber L. Metabolitos Rank Products Análise discriminante por mínimos quadrados parciais Teses de mestrado - 2020 |
| Ano: | 2020 |
| País: | Portugal |
| Tipo de documento: | dissertação de mestrado |
| Tipo de acesso: | acesso aberto |
| Instituição associada: | Universidade de Lisboa |
| Idioma: | português |
| Origem: | Repositório da Universidade de Lisboa |
| Resumo: | A associação simbiótica entre as raízes e fungos micorrízicos do solo é extremamente importante para a nutrição e desenvolvimento das plantas. Apesar de haver já algum conhecimento sobre os genes (genoma/transcritoma) e proteínas (proteoma) envolvidos no processo de micorrização, sabe-se muito pouco sobre as alterações dos metabolitos da planta hospedeira quando esta se encontra em simbioses com o fungo micorrízico. Assim, a identificação do conjunto de metabolitos ou compostos biológicos (metaboloma) envolvidos na micorrização reveste-se de especial interesse para completar a informação fornecida pelo genoma/transcritoma e proteoma. Estes são os últimos produtos da expressão dos genes e, por isso, são extremamente informativos acerca das alterações moleculares que estão a acontecer nos organismos vivos. Sabe-se que os organismos vivos sujeitos a stresses ambientais (e.g. seca, salinidade do solo) ou durante interações com microrganismos simbióticos ou patogénicos, podem produzir metabolitos específicos ou sofrer alterações na quantidade de metabolitos já produzidos. A identificação destas alterações permite saber, a nível molecular, o que está a acontecer quando uma planta estabelece, por exemplo, uma relação simbiótica com um fungo da rizosfera. Neste estudo pretendeu-se contribuir para a identificação das alterações no metaboloma do sobreiro quando este se encontra em simbiose com um fungo micorrízico do solo. O metaboloma da raíz micorrizada do sobreiro foi extraído usando quatro frações compostas por diferentes solventes: água, metanol, acetonitrilo e clorofórmio (orgânica). Foram extraídas seis réplicas de plantas de sobreiros – sendo três micorrizadas e três utilizadas como grupo de controlo não micorrizado, para efeitos de comparação. Através da aplicação de métodos estatísticos tais como Rank Products, Modelos Lineares e Análise Discriminante por Mínimos Quadrados Parciais (PLS-DA) , foi possível a identificação dos metabolitos diferencialmente acumulados que possibilitarão a descoberta de novas informações sobre a identidade dos metabolitos envolvidos na simbiose entre o sobreiro e o fungo micorrízico, promovendo novos conhecimentos sobre as vias metabólicas implicadas na micorrização. |
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