Publicação
Validation of automatic similarity measures
| Resumo: | A capacidade para comparar automaticamente duas entidades biomédicas (p. ex. doenças, vias metabólicas ou artigos científicos) permite que os computadores raciocinem sobre o conhecimento científico. Assim sendo, fazer a validação destas medidas é essencial para garantir que os resultados produzidos por elas reflictam o actual conhecimento colectivo sobre o respectivo domínio. Uma das estratégias para avaliar se a medida é precisa e funcional é a validação manual por parte de peritos. Contudo, este processo é ineficiente devido a toda a pesquisa secundária necessária para o fazer, o que significa que compilar grandes conjuntos de dados de valores de semelhança atribuídos por humanos é uma tarefa difícil. “Manual Validation Helper Tool” (MVHT) é uma aplicação web criada com o intuito de acelerar esta validação manual, em conjunto com um formato capaz de acomodar os diversos tipos de dados em forma de anotações, provenientes de diferentes ontologias ou domínios. MVHT foi testada em quatro datasets distintos e um deles foi apresentado a utilizadores piloto para que dessem o seu feedback acerca do que poderia ser melhorado na aplicação, bem como para se obter um gold-standard de semelhança manual. Com o seu auxílio, a ferramenta foi optimizada e encontra-se acessível para ser usada por criadores de medidas de semelhança semântica, que por sua vez podem partilhar os seus datasets de forma prática, os quais peritos podem visitar e rapidamente começar a comparar pares de entidades. |
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| Autores principais: | Santos, Pedro Jorge Mendes dos |
| Assunto: | Ferramenta web Ontologias biomédicas Validação manual Multidisciplinaridade de dados biomédicos Teses de mestrado - 2020 |
| Ano: | 2020 |
| País: | Portugal |
| Tipo de documento: | dissertação de mestrado |
| Tipo de acesso: | acesso aberto |
| Instituição associada: | Universidade de Lisboa |
| Idioma: | inglês |
| Origem: | Repositório da Universidade de Lisboa |
| Resumo: | A capacidade para comparar automaticamente duas entidades biomédicas (p. ex. doenças, vias metabólicas ou artigos científicos) permite que os computadores raciocinem sobre o conhecimento científico. Assim sendo, fazer a validação destas medidas é essencial para garantir que os resultados produzidos por elas reflictam o actual conhecimento colectivo sobre o respectivo domínio. Uma das estratégias para avaliar se a medida é precisa e funcional é a validação manual por parte de peritos. Contudo, este processo é ineficiente devido a toda a pesquisa secundária necessária para o fazer, o que significa que compilar grandes conjuntos de dados de valores de semelhança atribuídos por humanos é uma tarefa difícil. “Manual Validation Helper Tool” (MVHT) é uma aplicação web criada com o intuito de acelerar esta validação manual, em conjunto com um formato capaz de acomodar os diversos tipos de dados em forma de anotações, provenientes de diferentes ontologias ou domínios. MVHT foi testada em quatro datasets distintos e um deles foi apresentado a utilizadores piloto para que dessem o seu feedback acerca do que poderia ser melhorado na aplicação, bem como para se obter um gold-standard de semelhança manual. Com o seu auxílio, a ferramenta foi optimizada e encontra-se acessível para ser usada por criadores de medidas de semelhança semântica, que por sua vez podem partilhar os seus datasets de forma prática, os quais peritos podem visitar e rapidamente começar a comparar pares de entidades. |
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