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Nova metodologia computacional de “Docking” proteína-ligando utilizando o AutoDock4

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Detalhes bibliográficos
Resumo:O principal objectivo do "docking" proteína-ligando é tentar prever como moléculas, tais como substratos ou potenciais fármacos, podem interagir com uma proteína alvo de estrutura 3D conhecida. O "docking" proteína-ligando pode ser utilizada para levar a cabo a análise de muitos ligandos potenciais e é uma ferramenta cada vez mais importante na descoberta de novos fármacos, uma vez que pode reduzir significativamente o número de compostos que numa fase posterior serão experimentalmente investigados. Contudo, esta metodologia requer uma grande capacidade de processamento computacional e muitas vezes são utilizados "clusters" de computador com Alto Desempenho Computacional (HPC- High Througoutput computing). Neste trabalho descrevemos um método para a construção de um "cluster" que pode ser utilizado para analisar um grande número de compostos utilizando o programa Autodock 4.0 [1] e uma plataforma HPC baseada no sistema operativo ParallelK.noppix (Linux) [2].
Autores principais:Abreu, Rui M.V.
Outros Autores:Froufe, Hugo J.C.; Queiroz, Maria João R.P.; Ferreira, Isabel C.F.R.
Ano:2009
País:Portugal
Tipo de documento:documento de conferência
Tipo de acesso:acesso aberto
Instituição associada:Instituto Politécnico de Bragança
Idioma:português
Origem:Biblioteca Digital do IPB

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