Publicação
Segmentação, crescimento e seguimento de células Escherichia coli em imagens microscópicas
| Resumo: | Este trabalho tem como finalidade a obtenção do seguimento celular, sendo importante para os profissionais da área da microbiologia, visto que auxilia na contagem de células e na evolução e crescimento das mesmas de modo a diminuir os erros de contagem e seguimento manual das células. Neste projeto aborda-se o crescimento celular de células Escherichia coli (E.coli), a segmentação de células e o seguimento celular. Primeiramente analisou-se o software schnitzcells que é um programa de seguimento de células e deste modo procedeu-se a um estudo na tentativa de obter melhores resultados. Desta forma, através de modificações no processo de segmentação obtiveram-se melhores resultados do que no programa schnitzcells. De seguida, aplicou-se o método de sobreposição de imagens aos pares de modo que os centróides das células na imagem seguinte estivessem sobrepostos com os centróides das células na imagem anterior e assim proceder-se ao seguimento celular. No seguimento celular verificou-se os centróides dos objetos na imagem seguinte encontravam-se no interior de uma célula na imagem anterior e também calculou-se a distância mínima entre objetos, uma vez que existiam células não sobrepostas e deste modo obteve-se o seguimento celular. Assim, constata-se melhores resultados na metodologia implementada, visto que o processo realiza-se de forma automática enquanto no software schnitzcells necessita de correções manuais a nível da segmentação e do seguimento celular para obterem-se resultados corretos. |
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| Autores principais: | Santos, Diana Isabel Campos |
| Assunto: | Células E.Coli Segmentação de células Seguimento celular Software Schnitzcells |
| Ano: | 2017 |
| País: | Portugal |
| Tipo de documento: | dissertação de mestrado |
| Tipo de acesso: | acesso aberto |
| Instituição associada: | Instituto Politécnico de Bragança |
| Idioma: | português |
| Origem: | Biblioteca Digital do IPB |
| Resumo: | Este trabalho tem como finalidade a obtenção do seguimento celular, sendo importante para os profissionais da área da microbiologia, visto que auxilia na contagem de células e na evolução e crescimento das mesmas de modo a diminuir os erros de contagem e seguimento manual das células. Neste projeto aborda-se o crescimento celular de células Escherichia coli (E.coli), a segmentação de células e o seguimento celular. Primeiramente analisou-se o software schnitzcells que é um programa de seguimento de células e deste modo procedeu-se a um estudo na tentativa de obter melhores resultados. Desta forma, através de modificações no processo de segmentação obtiveram-se melhores resultados do que no programa schnitzcells. De seguida, aplicou-se o método de sobreposição de imagens aos pares de modo que os centróides das células na imagem seguinte estivessem sobrepostos com os centróides das células na imagem anterior e assim proceder-se ao seguimento celular. No seguimento celular verificou-se os centróides dos objetos na imagem seguinte encontravam-se no interior de uma célula na imagem anterior e também calculou-se a distância mínima entre objetos, uma vez que existiam células não sobrepostas e deste modo obteve-se o seguimento celular. Assim, constata-se melhores resultados na metodologia implementada, visto que o processo realiza-se de forma automática enquanto no software schnitzcells necessita de correções manuais a nível da segmentação e do seguimento celular para obterem-se resultados corretos. |
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