Publicação
Mining images of microbial communities for morphological characteristics in a support of clinical decision making
| Resumo: | Um biofilme é uma comunidade de microrganismos envoltos por uma matriz extracelular produzida pelos próprios, que lhes garante proteção. Os biofilmes representam um problema para a saúde pública pois facilmente encontram-se em dispositivos médicos, podendo causar problemas graves para os pacientes. Estudos prévios indicam algumas alterações observáveis do aspeto físico e bioquímico das comunidades microbianas na resposta à resistência e à virulência. Assim a morfologia da comunidade pode ser um indicativo da reação regulatória associada com fenómenos de patogenicidade microbiana. O objetivo deste trabalho é por um lado a criação de um novo sistema de classificação de morfologia de colonia com medidas extraídas de softwares de imagem por outro lado, o estudo da classificação morfológica existente e do novo sistema de classificação, através de técnicas de mineração de dados com o objetivo de ajudar nestas classificações. Apresentamos vários softwares como solução que vão desde a caraterização da estrutura dos biofilmes até a caraterização de morfologia de colonia |
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| Autores principais: | Domingues, Ana Catarina de Jesus |
| Assunto: | Biofilmes Morfologia de colonia Processamento de imagens Mineração de dados Biofilms Colony morphology Image processing Data mining |
| Ano: | 2013 |
| País: | Portugal |
| Tipo de documento: | dissertação de mestrado |
| Tipo de acesso: | acesso aberto |
| Instituição associada: | Universidade do Minho |
| Idioma: | inglês |
| Origem: | RepositóriUM - Universidade do Minho |
| Resumo: | Um biofilme é uma comunidade de microrganismos envoltos por uma matriz extracelular produzida pelos próprios, que lhes garante proteção. Os biofilmes representam um problema para a saúde pública pois facilmente encontram-se em dispositivos médicos, podendo causar problemas graves para os pacientes. Estudos prévios indicam algumas alterações observáveis do aspeto físico e bioquímico das comunidades microbianas na resposta à resistência e à virulência. Assim a morfologia da comunidade pode ser um indicativo da reação regulatória associada com fenómenos de patogenicidade microbiana. O objetivo deste trabalho é por um lado a criação de um novo sistema de classificação de morfologia de colonia com medidas extraídas de softwares de imagem por outro lado, o estudo da classificação morfológica existente e do novo sistema de classificação, através de técnicas de mineração de dados com o objetivo de ajudar nestas classificações. Apresentamos vários softwares como solução que vão desde a caraterização da estrutura dos biofilmes até a caraterização de morfologia de colonia |
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