Publicação
RealROC: a shiny based application for ROC curve study with covariate adjustment
| Resumo: | A curva ROC (Receiver operating characteristic) é uma ferramenta analítica eficaz para testes clínicos. A análise permite visualizar a variação de sensibilidade e especificidade para uma dada região de corte através de um simples, mas robusto gráfico bidimensional. Num contexto biológico, testes podem ser influenciados por múltiplas variáveis externas e como tal a análise ROC pode não ser a ideal ou gerar resultados incompletos. É então necessário saber que variáveis afetam determinado teste clínico de forma a determinar os melhores parâmetros para determinado teste ou até descartar determinada metodologia mediante a situação. O ajuste da curva ROC a covariáveis permite a normalização do efeito das mesmas ou diretamente ajustar a curva para os seus efeitos. Software direcionado ao ajuste da curva ROC é, infelizmente, escasso e muitas vezes difícil de manusear por utilizadores não especializados. Recentemente o pacote AROC foi lançando para R que disponibiliza vários recursos para estes ajustamentos, no entanto a dificuldade de utilização mantém-se. A combinação deste pacote com a estrutura Shiny, um pacote que permite o desenvolvimento de aplicações interativas, tem por objetivo a criação de um programa grátis e acessível que permita uma análise mais aprofundada disponível para todos os investigadores. RealROC foi capaz de replicar resultados de um caso de estudo que analisou a influência do sexo no sistema de pontuação CRIB e respetiva previsão de mortalidade, demonstrando a usabilidade e acessibilidade do programa que será disponibilizado online e potencialmente contribuir para novos desenvolvimentos na área. |
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| Autores principais: | Costa, Francisco Luís do Amaral Ribeiro Machado e |
| Assunto: | Curva ROC AROC Covariáveis Shiny Bioestatística Informática médica Classificação estatística Software ROC curve Covariates Biostatistics Medical informatics Statistical classification |
| Ano: | 2020 |
| País: | Portugal |
| Tipo de documento: | dissertação de mestrado |
| Tipo de acesso: | acesso aberto |
| Instituição associada: | Universidade do Minho |
| Idioma: | inglês |
| Origem: | RepositóriUM - Universidade do Minho |
| Resumo: | A curva ROC (Receiver operating characteristic) é uma ferramenta analítica eficaz para testes clínicos. A análise permite visualizar a variação de sensibilidade e especificidade para uma dada região de corte através de um simples, mas robusto gráfico bidimensional. Num contexto biológico, testes podem ser influenciados por múltiplas variáveis externas e como tal a análise ROC pode não ser a ideal ou gerar resultados incompletos. É então necessário saber que variáveis afetam determinado teste clínico de forma a determinar os melhores parâmetros para determinado teste ou até descartar determinada metodologia mediante a situação. O ajuste da curva ROC a covariáveis permite a normalização do efeito das mesmas ou diretamente ajustar a curva para os seus efeitos. Software direcionado ao ajuste da curva ROC é, infelizmente, escasso e muitas vezes difícil de manusear por utilizadores não especializados. Recentemente o pacote AROC foi lançando para R que disponibiliza vários recursos para estes ajustamentos, no entanto a dificuldade de utilização mantém-se. A combinação deste pacote com a estrutura Shiny, um pacote que permite o desenvolvimento de aplicações interativas, tem por objetivo a criação de um programa grátis e acessível que permita uma análise mais aprofundada disponível para todos os investigadores. RealROC foi capaz de replicar resultados de um caso de estudo que analisou a influência do sexo no sistema de pontuação CRIB e respetiva previsão de mortalidade, demonstrando a usabilidade e acessibilidade do programa que será disponibilizado online e potencialmente contribuir para novos desenvolvimentos na área. |
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