Publicação
Modelação da interação da glicoproteína e do vírus do dengue com ligantes de interesse farmacológico
| Resumo: | A doença do Dengue tem vindo a afetar parte da população mundial, sem que haja cura ou prevenção possível. O vírus do Dengue (DENV) tem atualmente quatro serotipos distintos, existindo já rumores de um quinto. A doença provocada pelo DENV pode atingir extremos, sendo que o doente pode ter uma recuperação a 100% ou poderá morrer devido a um choque hemorrágico. Desde o século passado que se luta contra a doença tentando encontrar algum tipo de cura ou prevenção, mas sempre sem sucesso. Estas investigações, têm tido diferentes focos, desde o mosquito Aedes Aegypti à conceção de fármacos antivirais eficazes contra o DENV. A Simulação Computacional, tem sido uma preciosa ajuda no estudo da estrutura do vírus DENV, e no desenvolvimento de novos fármacos antivirais. Em combinação com as técnicas laboratoriais, a Simulação Computacional, tem fornecido informações que é impossível observar experimentalmente. Com a ajuda computacional, obtemos informações como valores de energias e orientações moleculares possíveis em mecanismos de ação de determinada biomolécula. Este trabalho de tese consiste no estudo por simulação computacional das estruturas específicas da Glicoproteína E presente na superfície do vírus do Dengue e a identificação de possíveis alvos para fármacos antivirais. Esta tese foi levada a cabo em paralelo com um estudo experimental realizado pelo Prof. Léo Degrève, na Universidade de São Paulo, visando a identificação e teste de novos fármacos antivirais para o DENGUE. O objetivo desta tese é a elaboração de um protocolo de simulação que permita prever de forma sistemática e precisa, a energia de ligação entre um ligante e um recetor, usando métodos de simulação híbridos combinado simulações de dinâmica molecular e mecânica quântica. Esta tese está organizada em quatro capítulos. O primeiro capítulo, será a parte introdutória será uma breve explicação do vírus em estudo e, dos métodos computacionais. No segundo capítulo, estarão explicados todos os materiais utilizados e, assim como os parâmetros usados nas simulações computacionais. Nesta secção, será apresentado o protocolo completo para a realização deste estudo. O terceiro capítulo, consistirá na apresentação e discussão dos resultados obtidos de todo o processo anterior. Por último, o quarto capítulo, consistirá na conclusão final do trabalho analisando todo o processo, evidenciando o que foi favorável e o que deveria ter sido feito para obter melhores resultados. |
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| Autores principais: | Queirós, Sara Flor da Silva |
| Assunto: | Ciências Naturais::Outras Ciências Naturais |
| Ano: | 2016 |
| País: | Portugal |
| Tipo de documento: | dissertação de mestrado |
| Tipo de acesso: | acesso aberto |
| Instituição associada: | Universidade do Minho |
| Idioma: | português |
| Origem: | RepositóriUM - Universidade do Minho |
| Resumo: | A doença do Dengue tem vindo a afetar parte da população mundial, sem que haja cura ou prevenção possível. O vírus do Dengue (DENV) tem atualmente quatro serotipos distintos, existindo já rumores de um quinto. A doença provocada pelo DENV pode atingir extremos, sendo que o doente pode ter uma recuperação a 100% ou poderá morrer devido a um choque hemorrágico. Desde o século passado que se luta contra a doença tentando encontrar algum tipo de cura ou prevenção, mas sempre sem sucesso. Estas investigações, têm tido diferentes focos, desde o mosquito Aedes Aegypti à conceção de fármacos antivirais eficazes contra o DENV. A Simulação Computacional, tem sido uma preciosa ajuda no estudo da estrutura do vírus DENV, e no desenvolvimento de novos fármacos antivirais. Em combinação com as técnicas laboratoriais, a Simulação Computacional, tem fornecido informações que é impossível observar experimentalmente. Com a ajuda computacional, obtemos informações como valores de energias e orientações moleculares possíveis em mecanismos de ação de determinada biomolécula. Este trabalho de tese consiste no estudo por simulação computacional das estruturas específicas da Glicoproteína E presente na superfície do vírus do Dengue e a identificação de possíveis alvos para fármacos antivirais. Esta tese foi levada a cabo em paralelo com um estudo experimental realizado pelo Prof. Léo Degrève, na Universidade de São Paulo, visando a identificação e teste de novos fármacos antivirais para o DENGUE. O objetivo desta tese é a elaboração de um protocolo de simulação que permita prever de forma sistemática e precisa, a energia de ligação entre um ligante e um recetor, usando métodos de simulação híbridos combinado simulações de dinâmica molecular e mecânica quântica. Esta tese está organizada em quatro capítulos. O primeiro capítulo, será a parte introdutória será uma breve explicação do vírus em estudo e, dos métodos computacionais. No segundo capítulo, estarão explicados todos os materiais utilizados e, assim como os parâmetros usados nas simulações computacionais. Nesta secção, será apresentado o protocolo completo para a realização deste estudo. O terceiro capítulo, consistirá na apresentação e discussão dos resultados obtidos de todo o processo anterior. Por último, o quarto capítulo, consistirá na conclusão final do trabalho analisando todo o processo, evidenciando o que foi favorável e o que deveria ter sido feito para obter melhores resultados. |
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