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Compilação de uma biblioteca de referência de DNA barcodes para peixes marinhos de Portugal e estudo filogeográfico da espécie Zeus faber

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Detalhes bibliográficos
Resumo:Lançada em 2005 e recorrendo à abordagem da técnica DNA barcoding, a campanha FISH-BOL, integrada na iniciativa Barcode of Life (BOLI), constitui uma iniciativa internacional que tem como objetivo criar uma ampla biblioteca de códigos de barras de DNA - DNA barcodes - para a identificação de qualquer espécie de peixe, examinando igualmente a diversidade molecular dos mesmos através de um esquema de múltiplas espécies/marcadores genéticos únicos. Dividido em duas partes distintas, este trabalho teve como objetivos alargar a biblioteca de referência de DNA barcodes de peixes marinhos da costa portuguesa devidamente validados com um sistema de classificação e investigar padrões filogeográficos da espécie Zeus faber, através da análise conjunta de segmentos de DNA mitocondrial (COI-5P) e de DNA nuclear (intrão do gene S7). Recorrendo às técnicas moleculares e aos protocolos da técnica DNA barcoding, a biblioteca de referência de DNA barcodes de peixes marinhos de Portugal contabiliza, até ao momento, 793 sequências distribuídas por 148 espécies, 120 géneros e 87 famílias. Salvo algumas exceções, os espécimes agruparam em clados monofiléticos da mesma espécie com valores de divergência inferiores a 2%. A aplicação do sistema de classificação à nossa biblioteca de referência resultou num total de 78% das sequências corretamente identificadas. Relativamente ao estudo da espécie Zeus faber, a análise das 87 sequências de COI-5P originou a formação de dois clados significativamente distintos, clado do hemisfério Norte e clado do hemisfério Sul. Igualmente, a análise às 24 sequências do intrão de S7 originou os mesmos resultados sugerindo, assim, que poderemos estar perante um caso de espécie críptica, facto este que merece uma maior atenção em estudos futuros. Para além de facilitar a identificação de espécies de peixes marinhos para profissionais que precisem de uma identificação rápida e objetiva no seu dia-a-dia, resolvendo também conflitos taxonómicos em espécies exploradas comercialmente e de grande importância económica, a compilação final deste trabalho possibilitará uma análise multi-específica de padrões genéticos globais para um conjunto significativo de espécies de peixes marinhas, compreendendo diferentes estratégias reprodutoras, comportamentais ecológicas, podendo ainda servir como base para estudos futuros de monitorização da diversidade aquática marinha.
Autores principais:Castro, Cláudia Soraia Lopes
Ano:2013
País:Portugal
Tipo de documento:dissertação de mestrado
Tipo de acesso:acesso restrito
Instituição associada:Universidade do Minho
Idioma:português
Origem:RepositóriUM - Universidade do Minho
Descrição
Resumo:Lançada em 2005 e recorrendo à abordagem da técnica DNA barcoding, a campanha FISH-BOL, integrada na iniciativa Barcode of Life (BOLI), constitui uma iniciativa internacional que tem como objetivo criar uma ampla biblioteca de códigos de barras de DNA - DNA barcodes - para a identificação de qualquer espécie de peixe, examinando igualmente a diversidade molecular dos mesmos através de um esquema de múltiplas espécies/marcadores genéticos únicos. Dividido em duas partes distintas, este trabalho teve como objetivos alargar a biblioteca de referência de DNA barcodes de peixes marinhos da costa portuguesa devidamente validados com um sistema de classificação e investigar padrões filogeográficos da espécie Zeus faber, através da análise conjunta de segmentos de DNA mitocondrial (COI-5P) e de DNA nuclear (intrão do gene S7). Recorrendo às técnicas moleculares e aos protocolos da técnica DNA barcoding, a biblioteca de referência de DNA barcodes de peixes marinhos de Portugal contabiliza, até ao momento, 793 sequências distribuídas por 148 espécies, 120 géneros e 87 famílias. Salvo algumas exceções, os espécimes agruparam em clados monofiléticos da mesma espécie com valores de divergência inferiores a 2%. A aplicação do sistema de classificação à nossa biblioteca de referência resultou num total de 78% das sequências corretamente identificadas. Relativamente ao estudo da espécie Zeus faber, a análise das 87 sequências de COI-5P originou a formação de dois clados significativamente distintos, clado do hemisfério Norte e clado do hemisfério Sul. Igualmente, a análise às 24 sequências do intrão de S7 originou os mesmos resultados sugerindo, assim, que poderemos estar perante um caso de espécie críptica, facto este que merece uma maior atenção em estudos futuros. Para além de facilitar a identificação de espécies de peixes marinhos para profissionais que precisem de uma identificação rápida e objetiva no seu dia-a-dia, resolvendo também conflitos taxonómicos em espécies exploradas comercialmente e de grande importância económica, a compilação final deste trabalho possibilitará uma análise multi-específica de padrões genéticos globais para um conjunto significativo de espécies de peixes marinhas, compreendendo diferentes estratégias reprodutoras, comportamentais ecológicas, podendo ainda servir como base para estudos futuros de monitorização da diversidade aquática marinha.