Publicação

Caraterização de vírus específicos de insetos: análise da sua diversidade genética e relação com outros vírus

Detalhes bibliográficos
Resumo:	Os arbovírus são responsáveis por doenças com impacto significativo na saúde humana, sendo transmitidos a humanos e outros animais por insetos e outros vetores invertebrados. Entre estes últimos, os mosquitos representam um dos mais importantes vetores conhecidos por servirem de vetores a arbovírus patogénicos para os humanos, de que são exemplos os vírus da dengue e Zika. Por muito tempo, a pesquisa de vírus foi impulsionada pelo impacto que estes agentes impõem à saúde humana/animal/plantas, mas os desenvolvimentos nas últimas décadas nos domínios das tecnologias de sequenciação de alto rendimento e bioinformática permitiram melhorias nas estratégias de descoberta de vírus, o que, por sua vez, levou a um aumento no número de vírus peculiares que vieram a ser descobertos em rastreios virológicos, alguns com replicação restrita em células de vertebrados. Acredita-se que esses vírus, designados vírus específicos de insetos, tenham impacto nulo ou baixo na saúde animal e, provavelmente por isso mesmo, tenham permanecido à sombra de arbovírus patogénicos. No entanto, nas últimas décadas eles tornaram-se no foco da nossa atenção, não apenas pela sua extensa diversidade e estratégias incomuns de replicação restrita nalguns hospedeiros, mas também pelo seu potencial de interferir na replicação de arbovírus. Desde então, diversos vírus específicos de insetos foram descobertos em várias famílias de vírus, com vírus específicos de mosquitos associados especialmente às famílias Flaviviridae, Mesoniviridae e Parvoviridae. Neste projeto procurou-se detetar e analisar novas sequências de vírus específicos de insetos dessas três famílias virais em mosquitos coletados em Portugal, Angola e Moçambique. A diversidade genética, reconstrução filogenética e avaliações filodinâmicas foram então executadas, usando tanto sequências genómicas geradas de novo, bem como de sequências disponíveis em bases de dados públicas. Novas sequências de flavivírus específicos de insetos ditos "clássicos" (cISF) foram detetadas em pools de mosquitos das três regiões geográficas, e diferentes sub-linhagens de cISF foram caracterizadas. A sua análise filodinâmica sugeriu que a dispersão de cISF no espaço e no tempo deverá ser recente e bastante dinâmica. Por outro lado, embora dados insuficientes não tenham permitido uma análise filodinâmica completa com base em sequências de mesonivírus, foi realizada uma extensa revisão taxonómica, que incluiu a análise de sequências semelhantes a mesonivírus (meson-like viruses) recentemente detetadas em outros organismos que não mosquitos. Por fim, também procurámos analisar entre os parvovírus de invertebrados aqueles que têm sido incluídos no género Brevihamaparvovirus, cuja distribuição até ao momento parece ser restrita a algumas espécies de mosquitos. Os seus genomas parecem evoluir sob forte seleção negativa e também são caracterizados por baixa entropia, tal como foi igualmente observado para flavivírus e mesonivírus. Também realizámos uma revisão taxonómica do táxon (o primeiro para brevihamaparvovírus) e efetuámos a sua primeira reconstrução filodinâmica.
Autores principais:	MORAIS, Paulo Jorge Sampaio
Assunto:	Microbiologia Vírus de insetos Insetos Diversidade genética Reconstrução filogenética Filo dinâmica
Ano:	2022
País:	Portugal
Tipo de documento:	tese de doutoramento
Tipo de acesso:	acesso aberto
Instituição associada:	Universidade Nova de Lisboa
Idioma:	inglês
Origem:	Repositório Institucional da UNL

Descrição
Resumo:	Os arbovírus são responsáveis por doenças com impacto significativo na saúde humana, sendo transmitidos a humanos e outros animais por insetos e outros vetores invertebrados. Entre estes últimos, os mosquitos representam um dos mais importantes vetores conhecidos por servirem de vetores a arbovírus patogénicos para os humanos, de que são exemplos os vírus da dengue e Zika. Por muito tempo, a pesquisa de vírus foi impulsionada pelo impacto que estes agentes impõem à saúde humana/animal/plantas, mas os desenvolvimentos nas últimas décadas nos domínios das tecnologias de sequenciação de alto rendimento e bioinformática permitiram melhorias nas estratégias de descoberta de vírus, o que, por sua vez, levou a um aumento no número de vírus peculiares que vieram a ser descobertos em rastreios virológicos, alguns com replicação restrita em células de vertebrados. Acredita-se que esses vírus, designados vírus específicos de insetos, tenham impacto nulo ou baixo na saúde animal e, provavelmente por isso mesmo, tenham permanecido à sombra de arbovírus patogénicos. No entanto, nas últimas décadas eles tornaram-se no foco da nossa atenção, não apenas pela sua extensa diversidade e estratégias incomuns de replicação restrita nalguns hospedeiros, mas também pelo seu potencial de interferir na replicação de arbovírus. Desde então, diversos vírus específicos de insetos foram descobertos em várias famílias de vírus, com vírus específicos de mosquitos associados especialmente às famílias Flaviviridae, Mesoniviridae e Parvoviridae. Neste projeto procurou-se detetar e analisar novas sequências de vírus específicos de insetos dessas três famílias virais em mosquitos coletados em Portugal, Angola e Moçambique. A diversidade genética, reconstrução filogenética e avaliações filodinâmicas foram então executadas, usando tanto sequências genómicas geradas de novo, bem como de sequências disponíveis em bases de dados públicas. Novas sequências de flavivírus específicos de insetos ditos "clássicos" (cISF) foram detetadas em pools de mosquitos das três regiões geográficas, e diferentes sub-linhagens de cISF foram caracterizadas. A sua análise filodinâmica sugeriu que a dispersão de cISF no espaço e no tempo deverá ser recente e bastante dinâmica. Por outro lado, embora dados insuficientes não tenham permitido uma análise filodinâmica completa com base em sequências de mesonivírus, foi realizada uma extensa revisão taxonómica, que incluiu a análise de sequências semelhantes a mesonivírus (meson-like viruses) recentemente detetadas em outros organismos que não mosquitos. Por fim, também procurámos analisar entre os parvovírus de invertebrados aqueles que têm sido incluídos no género Brevihamaparvovirus, cuja distribuição até ao momento parece ser restrita a algumas espécies de mosquitos. Os seus genomas parecem evoluir sob forte seleção negativa e também são caracterizados por baixa entropia, tal como foi igualmente observado para flavivírus e mesonivírus. Também realizámos uma revisão taxonómica do táxon (o primeiro para brevihamaparvovírus) e efetuámos a sua primeira reconstrução filodinâmica.