Publicação
Análise Bioinformática da Via Hedgehog em Cancros Humanos: Expressão, Metilação e Impacto Prognóstico no KIRC e LGG
| Resumo: | O cancro é um dos maiores desafios da saúde global, resultando de alterações genéticas, epigenéticas e da desregulação de vias de sinalização. Esta tese centrou-se na via Hedgehog (HH), conservada evolutivamente e crucial no desenvolvimento embrionário, frequentemente desregulada em vários tipos de neoplasias. O objetivo principal foi analisar a expressão diferencial dos genes da via HH e associados em diversos cancros, com foco no carcinoma renal de células claras (KIRC) e no glioma de baixo grau (LGG), avaliando também o seu impacto prognóstico e potenciais mecanismos regulatórios. Utilizando abordagens bioinformáticas e bases de dados públicas (TCGA, GTEx, GEPIA2, cBioPortal, MethSurv, STRING, TIMER2.0, UCSC Xena Browser e UALCAN), foram analisados dados de expressão génica, metilação de DNA, mutações, infiltração imune e interações moleculares. Verificaram-se diferenças relevantes na expressão de CDON e LRP2 (KIRC) e de KIF7, BOC, CSNK1A1, CSNK1G3, PTCH1, GAS1, SMO e SUFU (LGG) entre tecidos tumorais e normais. A expressão elevada de LRP2 e CDON associou-se a melhor sobrevivência em KIRC, enquanto SUFU e PTCH1 mostraram efeito protetor em LGG. Por outro lado, SMO e GAS1 foram associados a pior prognóstico em LGG. Foi ainda observada hipermetilação dos promotores de CDON e LRP2 em KIRC, sugerindo regulação epigenética, enquanto em LGG a desregulação parece ocorrer por mecanismos não mutacionais. As redes de coexpressão revelaram interações com vias como Wnt e PI3K/AKT. Conclui-se que a via HH tem impacto distinto consoante o subtipo tumoral, e alguns genes, como LRP2 e CSNK1A1, podem constituir biomarcadores ou alvos terapêuticos promissores, reforçando a importância de análises multi-ómicas aplicadas à oncologia de precisão. |
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| Autores principais: | Aguiar, Diogo Gonçalo Ribeiro Paulo e Soares |
| Assunto: | Via hedgehog Cancro Bioinformática Metilação do dna Prognóstico Expressão génica |
| Ano: | 2025 |
| País: | Portugal |
| Tipo de documento: | dissertação de mestrado |
| Tipo de acesso: | acesso embargado |
| Instituição associada: | Universidade do Algarve |
| Idioma: | português |
| Origem: | Sapientia - Universidade do Algarve |
| Resumo: | O cancro é um dos maiores desafios da saúde global, resultando de alterações genéticas, epigenéticas e da desregulação de vias de sinalização. Esta tese centrou-se na via Hedgehog (HH), conservada evolutivamente e crucial no desenvolvimento embrionário, frequentemente desregulada em vários tipos de neoplasias. O objetivo principal foi analisar a expressão diferencial dos genes da via HH e associados em diversos cancros, com foco no carcinoma renal de células claras (KIRC) e no glioma de baixo grau (LGG), avaliando também o seu impacto prognóstico e potenciais mecanismos regulatórios. Utilizando abordagens bioinformáticas e bases de dados públicas (TCGA, GTEx, GEPIA2, cBioPortal, MethSurv, STRING, TIMER2.0, UCSC Xena Browser e UALCAN), foram analisados dados de expressão génica, metilação de DNA, mutações, infiltração imune e interações moleculares. Verificaram-se diferenças relevantes na expressão de CDON e LRP2 (KIRC) e de KIF7, BOC, CSNK1A1, CSNK1G3, PTCH1, GAS1, SMO e SUFU (LGG) entre tecidos tumorais e normais. A expressão elevada de LRP2 e CDON associou-se a melhor sobrevivência em KIRC, enquanto SUFU e PTCH1 mostraram efeito protetor em LGG. Por outro lado, SMO e GAS1 foram associados a pior prognóstico em LGG. Foi ainda observada hipermetilação dos promotores de CDON e LRP2 em KIRC, sugerindo regulação epigenética, enquanto em LGG a desregulação parece ocorrer por mecanismos não mutacionais. As redes de coexpressão revelaram interações com vias como Wnt e PI3K/AKT. Conclui-se que a via HH tem impacto distinto consoante o subtipo tumoral, e alguns genes, como LRP2 e CSNK1A1, podem constituir biomarcadores ou alvos terapêuticos promissores, reforçando a importância de análises multi-ómicas aplicadas à oncologia de precisão. |
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