Publicação
Anti and pro-longevity genes differentiation and overlap with age-related diseases
| Resumo: | Envelhecimento, longevidade e doenças associadas à idade (DAIs) são processos interligados e apresentam algumas semelhanças. A determinação e caracterização dos genes partilhados pelo envelhecimento ou longevidade e DAIs - genes AD - podem fornecer mais pistas acerca dos processos de regulação do envelhecimento e das DAIs, sendo este o propósito biomédico da pesquisa na área do envelhecimento. Na área da longevidade, existe já a distinção entre dois tipos de genes: anti e pró-longevidade. São considerados anti-longevidade genes cuja sobre-expressão promove a diminuição do tempo de vida; enquanto que a sobre-expressão de genes pró-longevidade está associada a um aumento do tempo de vida. No presente trabalho, foi realizado um tratamento do enviesamento presente na investigação e foram comparados os resultados das análises com e sem tratamento. O enviesamente presente na investigação resulta do conhecimento à priori que temos, por exemplo acerca de genes, e que nos conduz a uma seleção tendenciosa dos genes a estudar. Com o objetivo de definir quais os genes AD, foram realizadas análises de sobreposição sob quatro perspetivas: no genoma, no interactoma, incluindo os parceiros de primeira ordem considerando interações proteína-proteína e incluindo os genes co-expressos definidos por dados de RNA-Seq. Foram realizadas análises de algumas características e de mecanismos para os seguintes conjuntos de genes: genes AD, genes associados ao envelhecimento ou a doenças excluindo os comuns, genes anti-longevidade, genes pro-longevidade, genes associados ao envelhecimento e genes associados a doenças. Adicionalmente, para definir os genes mais comuns, foi analisada a frequência dos genes AD ao longo das DAIs. Suportado pelos resultados obtidos, a exclusão dos genes menos estudados conduz a resultados mais precisos e a definição do número mínimo de publicações pode ser um método para reduzir o enviesamento presente na investigação. O presente trabalho evidencia a associação entre envelhecimento e DAIs, assim como entre genes anti ou pró-longevidade e DAIs. Os genes envelhecimento-doença revelaram envolvimento nos principais mecanismos de envelhecimento e doenças conhecidos. As comparações do comprimento do gene, comprimento e massa da proteína, assim como da taxa de evolução molecular (dN/dS) não demonstraram nenhum padrão de distinção entre genes anti e pró-longevidade, apresentando apenas duas diferenças significativas: i) o comprimento da proteína codificada por genes anti-longevidade é o maior, na mosca da fruta e, ii) a taxa dN/dS dos genes anti-longevidade é a maior, na minhoca. Os genes envelhecimento-doenças apresentam um maior número de conexões com outros genes, o que frisa a sua importância nas redes do envelhecimento e DAIs. |
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| Autores principais: | Fernandes, Maria Isabel Mou Sequeira |
| Assunto: | Envelhecimento Anti-longevidade Pro-longevidade Doenças associadas à idade Investigação tendenciosa Teses de mestrado - 2015 |
| Ano: | 2015 |
| País: | Portugal |
| Tipo de documento: | dissertação de mestrado |
| Tipo de acesso: | acesso aberto |
| Instituição associada: | Universidade de Lisboa |
| Idioma: | inglês |
| Origem: | Repositório da Universidade de Lisboa |
| Resumo: | Envelhecimento, longevidade e doenças associadas à idade (DAIs) são processos interligados e apresentam algumas semelhanças. A determinação e caracterização dos genes partilhados pelo envelhecimento ou longevidade e DAIs - genes AD - podem fornecer mais pistas acerca dos processos de regulação do envelhecimento e das DAIs, sendo este o propósito biomédico da pesquisa na área do envelhecimento. Na área da longevidade, existe já a distinção entre dois tipos de genes: anti e pró-longevidade. São considerados anti-longevidade genes cuja sobre-expressão promove a diminuição do tempo de vida; enquanto que a sobre-expressão de genes pró-longevidade está associada a um aumento do tempo de vida. No presente trabalho, foi realizado um tratamento do enviesamento presente na investigação e foram comparados os resultados das análises com e sem tratamento. O enviesamente presente na investigação resulta do conhecimento à priori que temos, por exemplo acerca de genes, e que nos conduz a uma seleção tendenciosa dos genes a estudar. Com o objetivo de definir quais os genes AD, foram realizadas análises de sobreposição sob quatro perspetivas: no genoma, no interactoma, incluindo os parceiros de primeira ordem considerando interações proteína-proteína e incluindo os genes co-expressos definidos por dados de RNA-Seq. Foram realizadas análises de algumas características e de mecanismos para os seguintes conjuntos de genes: genes AD, genes associados ao envelhecimento ou a doenças excluindo os comuns, genes anti-longevidade, genes pro-longevidade, genes associados ao envelhecimento e genes associados a doenças. Adicionalmente, para definir os genes mais comuns, foi analisada a frequência dos genes AD ao longo das DAIs. Suportado pelos resultados obtidos, a exclusão dos genes menos estudados conduz a resultados mais precisos e a definição do número mínimo de publicações pode ser um método para reduzir o enviesamento presente na investigação. O presente trabalho evidencia a associação entre envelhecimento e DAIs, assim como entre genes anti ou pró-longevidade e DAIs. Os genes envelhecimento-doença revelaram envolvimento nos principais mecanismos de envelhecimento e doenças conhecidos. As comparações do comprimento do gene, comprimento e massa da proteína, assim como da taxa de evolução molecular (dN/dS) não demonstraram nenhum padrão de distinção entre genes anti e pró-longevidade, apresentando apenas duas diferenças significativas: i) o comprimento da proteína codificada por genes anti-longevidade é o maior, na mosca da fruta e, ii) a taxa dN/dS dos genes anti-longevidade é a maior, na minhoca. Os genes envelhecimento-doenças apresentam um maior número de conexões com outros genes, o que frisa a sua importância nas redes do envelhecimento e DAIs. |
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