Publicação
Aplicações com base em ontologias biomédicas: uma abordagem web semântica
| Resumo: | Este relatório apresenta o trabalho centrado na construção da BOA (BiomedicalOntology Applications) framework. A actividade de investigação BOA do grupo XLDB do LASIGE visa investigar e desenvolver aplicações para eficientemente explorar a informação contida nas ontologias biomédicas, por exemplo Gene Ontology (GO) e Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI). A actividade de investigação BOA disponibilizava três ferramentas web para a comunidade: ProteInOn, CMPSim e CESSM. O objectivo desta tese foi a integração destas ferramentas numa adordagem web semântica, com base numa framework composta por: i) back-end, onde os scripts correm, ii) mediador, um conjunto de serviços web que permite a comunicação entre os diferentes componentes da framework e iii) front-end, páginas web que permitem interagir e visualizar os resultados das ferramentas. Os serviços web foram desenvolvidos por forma a poderem ser utilizados internamente, por ferramentas criadas pelo grupo ou pelas páginas web das ferramentas, e externamente, de uma forma directa por utilizadores ou por integração noutras ferramentas ou páginas web. É de salientar que foram implementadas duas arquitecturas de serviços web de modo a cumprir todos os objectivos propostos. Uma arquitectura RESTful, facilitando assim a utilizadores sem conhecimentos de programação, e uma arquitectura RPC, que supera as limitações encontradas na arquitectura RESTful. |
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| Autores principais: | Tavares, Bruno Filipe Gomes Feteira da Costa |
| Assunto: | Serviços web RESTful RPC Ontologias biomédicas Web semântica Teses de mestrado - 2011 |
| Ano: | 2011 |
| País: | Portugal |
| Tipo de documento: | dissertação de mestrado |
| Tipo de acesso: | acesso aberto |
| Instituição associada: | Universidade de Lisboa |
| Idioma: | português |
| Origem: | Repositório da Universidade de Lisboa |
| Resumo: | Este relatório apresenta o trabalho centrado na construção da BOA (BiomedicalOntology Applications) framework. A actividade de investigação BOA do grupo XLDB do LASIGE visa investigar e desenvolver aplicações para eficientemente explorar a informação contida nas ontologias biomédicas, por exemplo Gene Ontology (GO) e Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI). A actividade de investigação BOA disponibilizava três ferramentas web para a comunidade: ProteInOn, CMPSim e CESSM. O objectivo desta tese foi a integração destas ferramentas numa adordagem web semântica, com base numa framework composta por: i) back-end, onde os scripts correm, ii) mediador, um conjunto de serviços web que permite a comunicação entre os diferentes componentes da framework e iii) front-end, páginas web que permitem interagir e visualizar os resultados das ferramentas. Os serviços web foram desenvolvidos por forma a poderem ser utilizados internamente, por ferramentas criadas pelo grupo ou pelas páginas web das ferramentas, e externamente, de uma forma directa por utilizadores ou por integração noutras ferramentas ou páginas web. É de salientar que foram implementadas duas arquitecturas de serviços web de modo a cumprir todos os objectivos propostos. Uma arquitectura RESTful, facilitando assim a utilizadores sem conhecimentos de programação, e uma arquitectura RPC, que supera as limitações encontradas na arquitectura RESTful. |
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