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ULChemDB: desenvolvimento e implementação de uma base de dados de compostos químicos para a Universidade de Lisboa

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Resumo:O crescimento exponencial do número de moléculas conhecidas diariamente implica a crescente necessidade de armazena-las em repositórios de forma consistente para não se perder informação. Um dos desafios é conseguir preservar dados experimentais associados a um dado composto químico de tal forma que, para cada composto, existia um determinado número de experiências efectuadas e os valores obtidos sejam armazenados e disponibilizados a comunidade científica. É no seguimento da ideia anterior que foi criado o ULChemDB, um novo repositório que irá servir toda a investigação nas áreas da Química e Quimio-informática da Universidade de Lisboa, recentemente criada. A informação disponibilizada é proveniente da Universidade, porém qualquer pessoa pode aceder ao sistema de informação, disponível em http//ulchemdb.lasige.di.fc.ul.pt, permitindo que a investigação realizada seja divulgada a nível externo, nomeadamente, a investigadores e estudantes e assim também permitir uma maior visibilidade da Quimio-informática em Portugal. O repositório ULChemDB foi desenvolvido através da cooperação entre a Faculdade de Ciências e a Faculdade de Farmácia da Universidade de Lisboa e pode ser dividido em duas partes funcionais. A primeira parte é a base de dados relacional que armazena toda a informação presente no repositório e que foi desenhada para poder suportar as diferentes experiências, enquanto a segunda parte é a interface que apresenta a informação contida pela primeira e utiliza tecnologias web para o utilizador poder realizar processos de pesquisa e gestão da informação. Actualmente, o ULChemDB contém ainda poucas moléculas provenientes da Base de ensaios fornecidos pela Prof. Doutora Rita Guedes, no entanto, é esperado que este número cresça muito com a divulgação do projecto e será, certamente, uma base de dados de referência em Portugal nas áreas da Quimio-informática e Química, podendo também no futuro atrair mais pessoas de outras áreas, como a Biologia e Bioinformática, uma vez que muitos compostos químicos são biologicamente importantes.
Autores principais:Monteiro, João Pedro Gonçalves
Assunto:Quimio-informática Universidade de Lisboa Base de dados de moléculas Sistemas de Informação e Arquitectura Web Teses de mestrado - 2015
Ano:2015
País:Portugal
Tipo de documento:dissertação de mestrado
Tipo de acesso:acesso aberto
Instituição associada:Universidade de Lisboa
Idioma:português
Origem:Repositório da Universidade de Lisboa
Descrição
Resumo:O crescimento exponencial do número de moléculas conhecidas diariamente implica a crescente necessidade de armazena-las em repositórios de forma consistente para não se perder informação. Um dos desafios é conseguir preservar dados experimentais associados a um dado composto químico de tal forma que, para cada composto, existia um determinado número de experiências efectuadas e os valores obtidos sejam armazenados e disponibilizados a comunidade científica. É no seguimento da ideia anterior que foi criado o ULChemDB, um novo repositório que irá servir toda a investigação nas áreas da Química e Quimio-informática da Universidade de Lisboa, recentemente criada. A informação disponibilizada é proveniente da Universidade, porém qualquer pessoa pode aceder ao sistema de informação, disponível em http//ulchemdb.lasige.di.fc.ul.pt, permitindo que a investigação realizada seja divulgada a nível externo, nomeadamente, a investigadores e estudantes e assim também permitir uma maior visibilidade da Quimio-informática em Portugal. O repositório ULChemDB foi desenvolvido através da cooperação entre a Faculdade de Ciências e a Faculdade de Farmácia da Universidade de Lisboa e pode ser dividido em duas partes funcionais. A primeira parte é a base de dados relacional que armazena toda a informação presente no repositório e que foi desenhada para poder suportar as diferentes experiências, enquanto a segunda parte é a interface que apresenta a informação contida pela primeira e utiliza tecnologias web para o utilizador poder realizar processos de pesquisa e gestão da informação. Actualmente, o ULChemDB contém ainda poucas moléculas provenientes da Base de ensaios fornecidos pela Prof. Doutora Rita Guedes, no entanto, é esperado que este número cresça muito com a divulgação do projecto e será, certamente, uma base de dados de referência em Portugal nas áreas da Quimio-informática e Química, podendo também no futuro atrair mais pessoas de outras áreas, como a Biologia e Bioinformática, uma vez que muitos compostos químicos são biologicamente importantes.