Publicação
Monitorização da presença de Tomato Leaf Curl New Delhi Virus (ToLCNDV) em campos de melão
| Resumo: | As viroses na cultura do melão, Cucumis melo L., têm causado elevadas perdas de produtividade, sendo o vírus Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV), recentemente identificado em cucurbitáceas, considerado um dos responsáveis pelas perdas relatadas. Neste contexto, a prospeção da presença do vírus ToLCNDV em campos de melão na região do Alentejo foi o principal objetivo deste trabalho, procurando-se estabelecer um teste molecular envolvendo extração de ADN e amplificação por PCR de sequências parciais do vírus que permitisse a sua identificação expedita e precoce. ToLCNDV é um begomovírus inicialmente encontrado na Índia em tomate que, recentemente, foi identificado em hospedeiros pertencentes às cucurbitáceas na Bacia do Mediterrâneo. A principal forma de transmissão é pelo seu vetor, a mosca-branca-do-feijão, Bemisia tabaci Genn., existindo outras duas formas de transmissão relatadas: inoculação mecânica e semente. A extração de ADN foi realizada através do DNeasy Plant Mini Kit e os primers específicos utilizados para identificação de ToLCNDV por PCR foram propostos para a estirpe presente na Bacia do Mediterrâneo, ToLCNDV-ES. Amostras de uma aboborinha com sintomas constituíram o controlo positivo utilizado para otimizar o método de extração de ADN e estabelecer a deteção do vírus por PCR, seguindo-se depois o mesmo método para análise de 35 amostras de melão de campo, igualmente sintomáticas. Os resultados da reação de amplificação e subsequente sequenciação permitiram detetar ToLCNDV nas amostras de aboborinha e em 10 amostras de melão. As sequências obtidas apresentaram homologia elevada com sequências de diferentes hospedeiros na Bacia do Mediterrâneo. Os isolados identificados foram recolhidos em duas regiões do país, evidenciando multiplicidade de hospedeiros. Com uma exceção, as mutações de nucleótidos conservadas não conduziram a diferentes aminoácidos. O teste estabelecido permitiu a deteção expedita de ToLCNDV em plantas de cucurbitáceas, o que pode conferir uma grande vantagem para os agricultores |
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| Autores principais: | Pedro, Mariana Cordeiro |
| Assunto: | vírus Nova Delhi cucurbitáceas mosca-branca-do-feijão (B. tabaci Genn.) PCR deteção precoce |
| Ano: | 2021 |
| País: | Portugal |
| Tipo de documento: | dissertação de mestrado |
| Tipo de acesso: | acesso aberto |
| Instituição associada: | Universidade de Lisboa |
| Idioma: | português |
| Origem: | Repositório da Universidade de Lisboa |
| Resumo: | As viroses na cultura do melão, Cucumis melo L., têm causado elevadas perdas de produtividade, sendo o vírus Tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV), recentemente identificado em cucurbitáceas, considerado um dos responsáveis pelas perdas relatadas. Neste contexto, a prospeção da presença do vírus ToLCNDV em campos de melão na região do Alentejo foi o principal objetivo deste trabalho, procurando-se estabelecer um teste molecular envolvendo extração de ADN e amplificação por PCR de sequências parciais do vírus que permitisse a sua identificação expedita e precoce. ToLCNDV é um begomovírus inicialmente encontrado na Índia em tomate que, recentemente, foi identificado em hospedeiros pertencentes às cucurbitáceas na Bacia do Mediterrâneo. A principal forma de transmissão é pelo seu vetor, a mosca-branca-do-feijão, Bemisia tabaci Genn., existindo outras duas formas de transmissão relatadas: inoculação mecânica e semente. A extração de ADN foi realizada através do DNeasy Plant Mini Kit e os primers específicos utilizados para identificação de ToLCNDV por PCR foram propostos para a estirpe presente na Bacia do Mediterrâneo, ToLCNDV-ES. Amostras de uma aboborinha com sintomas constituíram o controlo positivo utilizado para otimizar o método de extração de ADN e estabelecer a deteção do vírus por PCR, seguindo-se depois o mesmo método para análise de 35 amostras de melão de campo, igualmente sintomáticas. Os resultados da reação de amplificação e subsequente sequenciação permitiram detetar ToLCNDV nas amostras de aboborinha e em 10 amostras de melão. As sequências obtidas apresentaram homologia elevada com sequências de diferentes hospedeiros na Bacia do Mediterrâneo. Os isolados identificados foram recolhidos em duas regiões do país, evidenciando multiplicidade de hospedeiros. Com uma exceção, as mutações de nucleótidos conservadas não conduziram a diferentes aminoácidos. O teste estabelecido permitiu a deteção expedita de ToLCNDV em plantas de cucurbitáceas, o que pode conferir uma grande vantagem para os agricultores |
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