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Diversidade genómica, patogenicidade e sensibilidade a compostos bioactivos em Xanthomonas campestris

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Resumo:O género Xanthomonas pertence à subdivisão gama de Proteobacteria, incluindo 27 espécies fitopatogénicas que infectam 124 espécies de plantas monocotiledóneas e 268 de dicotiledóneas. 121 isolados de Xanthomonas spp. foram sujeitos a uma caracterização genotípica, utilizando BOX-, ERIC- e MSP-PCR. Esta estratégia permitiu a tipificação dos isolados de X. fragariae e X. campestris, revelando também a elevada variabilidade genotípica de algumas das espécies deste género, especialmente de X. axonopodis e espécies relacionadas. A caracterização fenética e filogenética de isolados portugueses de Xanthomonas spp. obtidos de crucíferas foi realizada utilizando a determinação do perfil metabólico, de testes de patogenicidade e ensaios biológicos em plantas diferenciadoras para determinação das raças de X. campestris pv. campestris (Xcc), PCR com 'primers' específicos, caracterização genotípica por rep-PCR, sequenciação do genes de rRNA 16S e de gyrB e análise dos espectros MALDI-ToF (Matrix Assisted Laser Dessorption Ionisation Time of Flight). Esta abordagem polifásica permitiu verificar a nível infra-específico a elevada diversidade genotípica e filogenética destes isolados, que contrasta com a homogeneidade das suas características culturais e metabólicas. Verificou-se também uma grande diversidade de perfis de patogenicidade, sendo apenas 32,4% dos isolados incluídos nas raças de Xcc, pelo que, na generalidade, a classificação em raças não se revelou adequada para a tipificação de perfis de virulência. A aplicação de MALDI-ToF originou uma árvore taxonómica de topologia semelhante à obtida com base na análise de gyrB, excepto para o isolado CPBF 1257. O isolado CPBF 47 revelou características atípicas para a generalidade das abordagens utilizadas, sendo exemplar único de uma espécie distinta das até agora descritas. Finalmente, determinou-se a sensibilidade de isolados de Xcc a compostos bioactivos presentes nos óleos essenciais de plantas aromáticas. Foi possível observar uma elevada actividade antibacteriana do óleo essencial de orégãos e cravinho, indicando o seu potencial como alternativa biotecnológica para o controlo de X. campestris e de espécies relacionadas.
Autores principais:Cruz, Joana Costa Cardoso da
Assunto:Biologia molecular Controlo biológico Óleos essenciais Plantas aromáticas Teses de mestrado
Ano:2009
País:Portugal
Tipo de documento:dissertação de mestrado
Tipo de acesso:acesso aberto
Instituição associada:Universidade de Lisboa
Idioma:português
Origem:Repositório da Universidade de Lisboa
Descrição
Resumo:O género Xanthomonas pertence à subdivisão gama de Proteobacteria, incluindo 27 espécies fitopatogénicas que infectam 124 espécies de plantas monocotiledóneas e 268 de dicotiledóneas. 121 isolados de Xanthomonas spp. foram sujeitos a uma caracterização genotípica, utilizando BOX-, ERIC- e MSP-PCR. Esta estratégia permitiu a tipificação dos isolados de X. fragariae e X. campestris, revelando também a elevada variabilidade genotípica de algumas das espécies deste género, especialmente de X. axonopodis e espécies relacionadas. A caracterização fenética e filogenética de isolados portugueses de Xanthomonas spp. obtidos de crucíferas foi realizada utilizando a determinação do perfil metabólico, de testes de patogenicidade e ensaios biológicos em plantas diferenciadoras para determinação das raças de X. campestris pv. campestris (Xcc), PCR com 'primers' específicos, caracterização genotípica por rep-PCR, sequenciação do genes de rRNA 16S e de gyrB e análise dos espectros MALDI-ToF (Matrix Assisted Laser Dessorption Ionisation Time of Flight). Esta abordagem polifásica permitiu verificar a nível infra-específico a elevada diversidade genotípica e filogenética destes isolados, que contrasta com a homogeneidade das suas características culturais e metabólicas. Verificou-se também uma grande diversidade de perfis de patogenicidade, sendo apenas 32,4% dos isolados incluídos nas raças de Xcc, pelo que, na generalidade, a classificação em raças não se revelou adequada para a tipificação de perfis de virulência. A aplicação de MALDI-ToF originou uma árvore taxonómica de topologia semelhante à obtida com base na análise de gyrB, excepto para o isolado CPBF 1257. O isolado CPBF 47 revelou características atípicas para a generalidade das abordagens utilizadas, sendo exemplar único de uma espécie distinta das até agora descritas. Finalmente, determinou-se a sensibilidade de isolados de Xcc a compostos bioactivos presentes nos óleos essenciais de plantas aromáticas. Foi possível observar uma elevada actividade antibacteriana do óleo essencial de orégãos e cravinho, indicando o seu potencial como alternativa biotecnológica para o controlo de X. campestris e de espécies relacionadas.