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Epidemiologia molecular e estudos filogenéticos de fungos dermatófitos de origem animal e humana

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Summary:Os dermatófitos são um grupo de fungos patogénicos filamentosos que invadem e infetam tecidos queratinizados. Estes provocam dermatofitoses, que apresentam uma prevalência global de cerca de 20-25%. Este estudo tem como principal objetivo a deteção, identificação e caraterização a nível microbiológico, molecular e filogenético de dermatófitos em diferentes amostras. As amostras foram recolhidas utilizando a técnica de Mackenzie e enviadas para o Laboratório de Microbiologia Médica da UTAD, onde posteriormente foram inoculadas em Dermathophyte Test Medium (DTM) e Potato Dextrose Agar (PDA). Neste estudo, foram analisadas um total de 40 amostras, 38 amostras de origem animal e 2 de origem humana. Através da aplicação da técnica do Lactofenol com Azul de Algodão foi possível a identificação de 6 destas amostras como sendo dermatófitos (prevalência de cerca de 15%), mais especificamente da espécie Nannizzia nana e Microsporum canis. Nannizzia nana é um fungo dermatófito zoofílico e geofílico que afeta animais, principalmente suínos, enquanto, Microsporum canis é um fungo dermatófito zoofílico, frequentemente encontrado em cães e gatos, sendo os gatos considerados os hospedeiros mais importantes. Só se conseguiu isolar em cultura pura as 4 amostras de N. nana, que foram depois transferidas para água destilada esterilizada para mais tarde proceder à sua análise molecular no laboratório de Genética Molecular Aplicada da UTAD. A extração de DNA das amostras foi realizada utilizando o kit Plant/Fungi DNA Isolation Kit. De seguida foi realizada uma PCR, utilizando 14 “primers” ISSRs. Os resultados revelaram uma percentagem de polimorfismo total, de cerca de 59%, sendo que, os “primers” que apresentaram maior número de bandas foram o UBC888 e UBC889, e que um “primer” obteve 100% de polimorfismo, o UBC808. Foi também elaborado um dendrograma, a análise deste permitiu perceber que, apesar de todas as amostras serem da mesma espécie, há uma elevada variabilidade genética com uma separação evidente das 4 amostras em dois grupos principais com um coeficiente de correlação de cerca de 0,62. Este estudo permitiu aumentar os conhecimentos a nível filogenético e epidemiológico desta espécie em amostras de animais. Numa perspetiva futura, seria interessante a realização de uma identificação molecular das amostras, com recurso a sequenciação, e aumentar o número de amostras.
Main Authors:Faria, Mariana Mendes
Subject:Dermatófitos Epidemiologia
Year:2022
Country:Portugal
Document type:master thesis
Access type:open access
Associated institution:Universidade de Trás-os-Montes e Alto Douro
Language:Portuguese
Origin:Repositório da UTAD
Description
Summary:Os dermatófitos são um grupo de fungos patogénicos filamentosos que invadem e infetam tecidos queratinizados. Estes provocam dermatofitoses, que apresentam uma prevalência global de cerca de 20-25%. Este estudo tem como principal objetivo a deteção, identificação e caraterização a nível microbiológico, molecular e filogenético de dermatófitos em diferentes amostras. As amostras foram recolhidas utilizando a técnica de Mackenzie e enviadas para o Laboratório de Microbiologia Médica da UTAD, onde posteriormente foram inoculadas em Dermathophyte Test Medium (DTM) e Potato Dextrose Agar (PDA). Neste estudo, foram analisadas um total de 40 amostras, 38 amostras de origem animal e 2 de origem humana. Através da aplicação da técnica do Lactofenol com Azul de Algodão foi possível a identificação de 6 destas amostras como sendo dermatófitos (prevalência de cerca de 15%), mais especificamente da espécie Nannizzia nana e Microsporum canis. Nannizzia nana é um fungo dermatófito zoofílico e geofílico que afeta animais, principalmente suínos, enquanto, Microsporum canis é um fungo dermatófito zoofílico, frequentemente encontrado em cães e gatos, sendo os gatos considerados os hospedeiros mais importantes. Só se conseguiu isolar em cultura pura as 4 amostras de N. nana, que foram depois transferidas para água destilada esterilizada para mais tarde proceder à sua análise molecular no laboratório de Genética Molecular Aplicada da UTAD. A extração de DNA das amostras foi realizada utilizando o kit Plant/Fungi DNA Isolation Kit. De seguida foi realizada uma PCR, utilizando 14 “primers” ISSRs. Os resultados revelaram uma percentagem de polimorfismo total, de cerca de 59%, sendo que, os “primers” que apresentaram maior número de bandas foram o UBC888 e UBC889, e que um “primer” obteve 100% de polimorfismo, o UBC808. Foi também elaborado um dendrograma, a análise deste permitiu perceber que, apesar de todas as amostras serem da mesma espécie, há uma elevada variabilidade genética com uma separação evidente das 4 amostras em dois grupos principais com um coeficiente de correlação de cerca de 0,62. Este estudo permitiu aumentar os conhecimentos a nível filogenético e epidemiológico desta espécie em amostras de animais. Numa perspetiva futura, seria interessante a realização de uma identificação molecular das amostras, com recurso a sequenciação, e aumentar o número de amostras.